21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02010 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  100 
 
 		 281 aa  568  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  37.2 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  37.45 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  30.97 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  29.1 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.34 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  30.04 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.41 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  29.28 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.57 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  29.39 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  30.36 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.68 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  26.12 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  29.31 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.4 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  32.16 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.54 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  31.67 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  30.36 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  25.63 
 
 		 764 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>