251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0580 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  100 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  50.57 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  45.86 
 
 		 275 aa  225  7e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.14 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  47.37 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  47.08 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  43.27 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.69 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  40 
 
 		 272 aa  202  7e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.45 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.66 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  42.57 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  42.96 
 
 		 274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  27.14 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  30.87 
 
 		 295 aa  128  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  26.55 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  36.2 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  31.28 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  31.53 
 
 		 764 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  29.2 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  25.37 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  28.63 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  28.63 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  25.88 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  26.56 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  24.31 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  26.56 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  28.35 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  26.17 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  26.56 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  27.06 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  26.4 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  26.17 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  26.17 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  25.88 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  27.27 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  25.95 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  25.1 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  27.64 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  28.4 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  27.67 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26622  predicted protein  29.81 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.604271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  26.98 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  28.12 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  24.43 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  26.13 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  25.64 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  27.56 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  26.38 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  26.67 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  28.02 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  28.02 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  25.79 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  25.98 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  24.21 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  25.79 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  26.02 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  27.63 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  26.42 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  27.82 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  26.89 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  26.09 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  26.4 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1106  ribonuclease PH  27.95 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  26.59 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  27.17 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  26.48 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  24.31 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  24.51 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  25.89 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  25.43 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  24.11 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  26.77 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  25.6 
 
 		 501 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  24.9 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  28.7 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  26.56 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  24.51 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  25.91 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  24.41 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  25.1 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1073  ribonuclease PH  28.25 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.213098  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  27.84 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  29.75 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  25.23 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1177  ribonuclease PH  30.3 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.217753 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01680  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  25.23 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  25.23 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  26.24 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  27.6 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  25.23 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  25.23 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2358  ribonuclease PH  27.56 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0822921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  25.79 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  25.34 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  26.29 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  27.23 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  30.41 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>