More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0199 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  100 
 
 		 343 aa  684    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  71.31 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  61.7 
 
 		 245 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  53.68 
 
 		 245 aa  265  7e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  53.78 
 
 		 245 aa  265  8.999999999999999e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  49.57 
 
 		 245 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  52.72 
 
 		 245 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  49.14 
 
 		 242 aa  228  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  49.34 
 
 		 244 aa  226  6e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  45.87 
 
 		 246 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  45.97 
 
 		 246 aa  209  6e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  47.18 
 
 		 246 aa  207  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  45.87 
 
 		 246 aa  186  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  32.2 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  32.08 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  32.22 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  33.33 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  36.76 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  32.92 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.93 
 
 		 700 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  34.45 
 
 		 705 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.76 
 
 		 777 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 258 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  33.47 
 
 		 239 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  31.4 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  33.76 
 
 		 238 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  32.71 
 
 		 241 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  32.07 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.9 
 
 		 712 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  29.71 
 
 		 238 aa  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.48 
 
 		 701 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0719  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.75 
 
 		 752 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000106259  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  32.07 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.03 
 
 		 693 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1442  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.6 
 
 		 735 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 238 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  32.91 
 
 		 238 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  32.91 
 
 		 238 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  32.91 
 
 		 238 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  29.48 
 
 		 250 aa  99.8  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.77 
 
 		 723 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  30.96 
 
 		 246 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 237 aa  99.4  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  30.8 
 
 		 240 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.3 
 
 		 703 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  31.33 
 
 		 248 aa  97.4  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  31.65 
 
 		 238 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  31.65 
 
 		 238 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  31.65 
 
 		 238 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  31.65 
 
 		 238 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  31.65 
 
 		 238 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  31.65 
 
 		 238 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  34.6 
 
 		 240 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.92 
 
 		 701 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 238 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30.93 
 
 		 693 aa  97.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  30.67 
 
 		 238 aa  97.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 238 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  31.65 
 
 		 237 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3854  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 712 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3845  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 712 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 238 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.86 
 
 		 699 aa  96.7  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1541  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.27 
 
 		 717 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1639  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.27 
 
 		 700 aa  96.3  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  31.09 
 
 		 241 aa  96.3  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  31.09 
 
 		 241 aa  96.3  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.78 
 
 		 699 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 237 aa  95.9  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 237 aa  96.3  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.84 
 
 		 710 aa  95.9  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.76 
 
 		 703 aa  95.9  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  32.2 
 
 		 241 aa  95.9  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 712 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0729219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3658  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 712 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3548  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 712 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3629  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 717 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3566  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 712 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3905  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 712 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  29.61 
 
 		 232 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  31.22 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 712 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.2 
 
 		 686 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 248 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3818  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 712 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.79465e-59 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  30.54 
 
 		 237 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  29.96 
 
 		 240 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2535  ribonuclease PH  31.22 
 
 		 237 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.1 
 
 		 708 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.1 
 
 		 708 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  31.51 
 
 		 237 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  31.51 
 
 		 237 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  33.17 
 
 		 230 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  36.41 
 
 		 288 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  31.51 
 
 		 237 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>