More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1362 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  66.96 
 
 		 501 aa  334  9e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  61.64 
 
 		 343 aa  321  8e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  59.48 
 
 		 245 aa  288  8e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  55.19 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  54.89 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  51.33 
 
 		 244 aa  253  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  51.88 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  47.81 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  47.16 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  48.03 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  48.47 
 
 		 246 aa  221  9e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  48.91 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  34.26 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  33.05 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  33.05 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  28.34 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  31.38 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  30.51 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  32.08 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  29.22 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.33 
 
 		 712 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  29.71 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  32.08 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  30.31 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  33.89 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.92 
 
 		 696 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.92 
 
 		 696 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  29.66 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.2 
 
 		 703 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.5 
 
 		 716 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.382985  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2997  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.97 
 
 		 711 aa  99.4  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.77 
 
 		 700 aa  99  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  29.91 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3845  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.2 
 
 		 712 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3854  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.2 
 
 		 712 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  29.96 
 
 		 263 aa  98.2  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  29.96 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.2 
 
 		 710 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.19 
 
 		 777 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3629  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.78 
 
 		 717 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.2 
 
 		 712 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0729219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3658  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.2 
 
 		 712 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3905  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.92 
 
 		 712 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3548  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.2 
 
 		 712 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.02 
 
 		 723 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3566  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.2 
 
 		 712 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  31.78 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.2 
 
 		 712 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3818  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.2 
 
 		 712 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.79465e-59 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0288  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.18 
 
 		 730 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0388227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  31.93 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1258  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.23 
 
 		 733 aa  96.3  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  30.8 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.89 
 
 		 699 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  29.83 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  34.75 
 
 		 288 aa  95.5  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  30.04 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0230  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.68 
 
 		 693 aa  94.7  1e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.336814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1442  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.05 
 
 		 735 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  30.25 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  30.47 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.17 
 
 		 703 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  35.51 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.47 
 
 		 690 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1950  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.52 
 
 		 740 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.139447  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.47 
 
 		 692 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  28.63 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0543  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.99 
 
 		 771 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.109089  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  31.95 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  29.54 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  29.96 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  29.96 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.48 
 
 		 697 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 747 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000737281  hitchhiker  0.00038852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  33.61 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3029  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.15 
 
 		 721 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  28.63 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  29.71 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 693 aa  93.2  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  29.96 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  29.75 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  30.93 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2897  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.6 
 
 		 725 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.35 
 
 		 701 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3192  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.18 
 
 		 715 aa  92.8  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.002791  normal  0.0369352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  29.54 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1656  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  34.32 
 
 		 736 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.16 
 
 		 772 aa  92.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  29.54 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  28.81 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_002978  WD0906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.92 
 
 		 757 aa  92  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.103984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4916  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.16 
 
 		 725 aa  92  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0719  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.49 
 
 		 752 aa  92  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.3 
 
 		 713 aa  92  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>