More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1057 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.91 
 
 		 734 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.91 
 
 		 711 aa  651    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3905  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.55 
 
 		 712 aa  821    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0970  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.36 
 
 		 720 aa  685    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.08 
 
 		 697 aa  687    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2763  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  55.72 
 
 		 698 aa  765    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.91 
 
 		 711 aa  651    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.87 
 
 		 701 aa  803    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.2 
 
 		 696 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3629  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.55 
 
 		 717 aa  813    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3845  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.99 
 
 		 712 aa  825    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3460  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.91 
 
 		 711 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0203  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.29 
 
 		 709 aa  672    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1950  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  55.37 
 
 		 740 aa  766    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.139447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1007  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.6 
 
 		 693 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0328519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0949  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  54.48 
 
 		 747 aa  731    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3658  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.7 
 
 		 712 aa  820    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3548  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.7 
 
 		 712 aa  821    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3566  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.7 
 
 		 712 aa  821    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  49.42 
 
 		 690 aa  678    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2816  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.53 
 
 		 729 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2685  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.39 
 
 		 729 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  49.42 
 
 		 692 aa  678    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.57 
 
 		 693 aa  652    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  53.54 
 
 		 777 aa  737    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.2 
 
 		 705 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0042224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.56 
 
 		 721 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3342  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.19 
 
 		 722 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0966  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.98 
 
 		 699 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000874082  normal  0.0188392 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0861  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.65 
 
 		 720 aa  700    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  59.42 
 
 		 710 aa  828    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3279  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 718 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.825925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1450  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  57.2 
 
 		 718 aa  794    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.103052  normal  0.272177 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2116  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.84 
 
 		 695 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.375436  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.57 
 
 		 708 aa  654    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  61.99 
 
 		 703 aa  876    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1561  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.69 
 
 		 699 aa  663    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000108143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  59.4 
 
 		 712 aa  841    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.19 
 
 		 706 aa  641    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1794  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.5 
 
 		 721 aa  639    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.864889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1674  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.58 
 
 		 703 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000759629  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0570  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.79 
 
 		 721 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.79 
 
 		 697 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2822  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.12 
 
 		 700 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000990055  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3592  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.2 
 
 		 705 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.42208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.7 
 
 		 712 aa  820    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  54.14 
 
 		 755 aa  706    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2440  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.22 
 
 		 716 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225847  normal  0.0323804 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12781  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.79 
 
 		 722 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245247  normal  0.0375904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.08 
 
 		 696 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.84 
 
 		 747 aa  811    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000737281  hitchhiker  0.00038852 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  48.91 
 
 		 734 aa  650    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.84 
 
 		 749 aa  646    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  100 
 
 		 701 aa  1395    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1360  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.87 
 
 		 698 aa  801    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.57 
 
 		 708 aa  654    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06021  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.5 
 
 		 721 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.293037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  63.04 
 
 		 700 aa  899    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.55 
 
 		 722 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.91 
 
 		 711 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  59.66 
 
 		 705 aa  837    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3818  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.55 
 
 		 712 aa  818    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.79465e-59 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3999  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.2 
 
 		 705 aa  651    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3588  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.43 
 
 		 746 aa  688    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.84 
 
 		 711 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.55 
 
 		 707 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0258  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.01 
 
 		 718 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.84 
 
 		 712 aa  823    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0729219 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0627  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.05 
 
 		 697 aa  639    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.44 
 
 		 815 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  53.09 
 
 		 703 aa  691    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1071  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  49.71 
 
 		 718 aa  655    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.679372  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0178  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.4 
 
 		 712 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.56 
 
 		 721 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.15 
 
 		 699 aa  650    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  53.02 
 
 		 686 aa  686    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.45 
 
 		 703 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141024  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1334  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.87 
 
 		 698 aa  801    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.94 
 
 		 722 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1934  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.48 
 
 		 702 aa  803    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.48 
 
 		 702 aa  803    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0703  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.97 
 
 		 713 aa  641    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1541  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.07 
 
 		 717 aa  667    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1639  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  66.91 
 
 		 700 aa  925    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0934  3' exoribonuclease  55.6 
 
 		 741 aa  754    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00161965  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.31 
 
 		 720 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0493  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.91 
 
 		 705 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000650099  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  59.28 
 
 		 703 aa  811    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.80141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.91 
 
 		 711 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3670  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.62 
 
 		 723 aa  824    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443696  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.91 
 
 		 711 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2047  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.79 
 
 		 769 aa  669    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0512862  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0114  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.15 
 
 		 741 aa  686    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.613671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3854  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.99 
 
 		 712 aa  825    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.38 
 
 		 699 aa  698    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.09 
 
 		 701 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  53.49 
 
 		 693 aa  716    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0968  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.93 
 
 		 706 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1005  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.85 
 
 		 718 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00579665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4265  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.07 
 
 		 715 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>