More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23286 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  100 
 
 		 274 aa  547  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  32.8 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  33.2 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  39.81 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  34.91 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  31.02 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  30.38 
 
 		 245 aa  122  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  34.84 
 
 		 501 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  32.53 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  31.25 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  34.57 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  36.89 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  33.73 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  32.11 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  34.5 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  33.86 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  33.05 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  33.1 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.17 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.31 
 
 		 701 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2745  ribonuclease PH  26.19 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  26.19 
 
 		 693 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  27.78 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1068  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  26.19 
 
 		 773 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.63376  normal  0.0171355 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0143  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.54 
 
 		 703 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000102458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1656  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.15 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14569  predicted protein  26.49 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0889855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  25 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  25.83 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3583  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  25.4 
 
 		 770 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0835  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.43 
 
 		 722 aa  57  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  31.73 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  29.3 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2440  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.73 
 
 		 716 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225847  normal  0.0323804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  29.51 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  25.76 
 
 		 786 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  30.1 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1822  3' exoribonuclease  29.72 
 
 		 714 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000787127  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1381  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  25.38 
 
 		 785 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491374  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0339  tRNA nucleotidyltransferase  27.02 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  28.06 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27 
 
 		 747 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000737281  hitchhiker  0.00038852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  28.51 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  25 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  25 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  25 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1794  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.99 
 
 		 721 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.864889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  25 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92599  predicted protein  27.38 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4265  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.06 
 
 		 715 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  25 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16651  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.01 
 
 		 722 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409727  normal  0.910712 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0810  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.01 
 
 		 722 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  29.74 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06021  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.24 
 
 		 721 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.293037 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  31.18 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5112  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  24.71 
 
 		 825 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191033  normal  0.121153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2132  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  25.91 
 
 		 773 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.8 
 
 		 723 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  26.59 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  24.61 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  24.61 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.1 
 
 		 693 aa  52.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0401  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.18 
 
 		 721 aa  52.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  25.31 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.57 
 
 		 708 aa  52.4  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  25.31 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32283  Exosome complex exonuclease RRP46 (Ribosomal RNA processing protein 46)  32.82 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0605509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  28.63 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  28.4 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  24.61 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1541  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.32 
 
 		 717 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.57 
 
 		 708 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  24.61 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  28.12 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0784  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  24.49 
 
 		 767 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1292  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.75 
 
 		 721 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  24.4 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3555  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.34 
 
 		 729 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.50127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  26.97 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.39 
 
 		 700 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.59 
 
 		 755 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.5 
 
 		 777 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  25.51 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0570  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.06 
 
 		 721 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0788  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.01 
 
 		 732 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000677019  normal  0.144869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0923  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.69 
 
 		 725 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1189  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.41 
 
 		 729 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.266903 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  26.97 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  24.8 
 
 		 699 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  27.68 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12322  predicted protein  32.86 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.683046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  26.48 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3279  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.12 
 
 		 718 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.825925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  28.12 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  25 
 
 		 705 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2047  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.81 
 
 		 769 aa  50.8  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0512862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>