130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03812 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  35.48 
 
 
241 aa  159  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  33.73 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  30.92 
 
 
501 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
262 aa  112  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  32.08 
 
 
343 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  28.34 
 
 
245 aa  106  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  26.21 
 
 
245 aa  99.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  36.13 
 
 
242 aa  92.4  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  26.97 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  30.32 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  29.68 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  32.88 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  30.57 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  27.04 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  29.19 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  29.45 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  32.43 
 
 
140 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.67 
 
 
700 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14569  predicted protein  25.24 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0889855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.83 
 
 
703 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.85 
 
 
701 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.48 
 
 
699 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0382  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.56 
 
 
714 aa  53.1  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.320403  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  24.02 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6517  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.7 
 
 
793 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433198  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2415  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  28.3 
 
 
730 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.556673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  23.58 
 
 
238 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.19 
 
 
703 aa  52.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0380  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.88 
 
 
703 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000345435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  24.43 
 
 
261 aa  52  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0934  3' exoribonuclease  29.38 
 
 
741 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00161965  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.19 
 
 
713 aa  51.6  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2811  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.78 
 
 
702 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212974  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1786  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.92 
 
 
717 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  28.48 
 
 
693 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3029  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.85 
 
 
721 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1334  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.57 
 
 
698 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1360  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.57 
 
 
698 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  26.71 
 
 
711 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01307  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.83 
 
 
704 aa  48.9  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1656  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  27.22 
 
 
736 aa  48.9  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.78 
 
 
712 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  25.45 
 
 
777 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4708  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.63 
 
 
701 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28 
 
 
701 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0552  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.81 
 
 
732 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4573  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.63 
 
 
701 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.348013  normal  0.924419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.63 
 
 
701 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181629  normal  0.111929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0725  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.63 
 
 
701 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.959792  normal  0.0305384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1854  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  27.39 
 
 
716 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1986  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  28.66 
 
 
708 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00363303  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  27.08 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4486  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.63 
 
 
701 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4176  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.63 
 
 
701 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310509  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.88 
 
 
723 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32283  Exosome complex exonuclease RRP46 (Ribosomal RNA processing protein 46)  28.99 
 
 
226 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0605509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1444  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.03 
 
 
714 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0398  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  25.86 
 
 
732 aa  47.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0783  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.19 
 
 
701 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00491346  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  26.32 
 
 
772 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0203  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.22 
 
 
709 aa  46.2  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0338  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  22.35 
 
 
796 aa  45.8  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0332916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.22 
 
 
713 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204835  normal  0.993933 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  22.48 
 
 
796 aa  45.8  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.35 
 
 
710 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1639  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.25 
 
 
700 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92599  predicted protein  28.14 
 
 
240 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798783  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  25.31 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  27.7 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  27.52 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  25.32 
 
 
703 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.80141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1950  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  25 
 
 
740 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.139447  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  20.87 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0569  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.99 
 
 
695 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0207  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.22 
 
 
700 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0436  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.25 
 
 
722 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  25 
 
 
757 aa  44.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.103984  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01680  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 
332 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1635  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.58 
 
 
732 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000929838  normal  0.469097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0605  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.22 
 
 
718 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.25 
 
 
715 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.102378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0227  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.22 
 
 
722 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133448  normal  0.547858 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57180  exosome exoribonuclease  22.39 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.659196  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0183  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.22 
 
 
700 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0506  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.22 
 
 
734 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1822  3' exoribonuclease  27.67 
 
 
714 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000787127  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1692  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.11 
 
 
735 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.739915  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  22.05 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2017  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  28.3 
 
 
718 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000536157  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  20.85 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0666  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.22 
 
 
728 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.95 
 
 
755 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3180  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  26.58 
 
 
746 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.846647 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0080  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.4 
 
 
700 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0788  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  26.58 
 
 
732 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000677019  normal  0.144869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2420  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.67 
 
 
736 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3232  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  26.54 
 
 
761 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.555601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42780  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.91 
 
 
702 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0599  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.95 
 
 
736 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>