More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0432 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  56.77 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  55.32 
 
 		 245 aa  271  9e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  55.46 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  51.53 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  53.71 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  52.63 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  51.9 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  51.33 
 
 		 245 aa  253  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  52.84 
 
 		 246 aa  247  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  51.09 
 
 		 501 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  47.58 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  49.34 
 
 		 343 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  31.02 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  33.75 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  33.2 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  30.8 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  31.54 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  32.64 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  32.63 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  30.58 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  32.08 
 
 		 258 aa  99.4  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  31.3 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  31.28 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  30.54 
 
 		 237 aa  95.5  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  35.57 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  31.09 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  29.41 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  28.45 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  30.25 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  32.22 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  29.05 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  33.86 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  31.65 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  30.29 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  30.89 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  32.8 
 
 		 238 aa  92.4  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  31.67 
 
 		 237 aa  92  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 		 262 aa  91.7  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  29.58 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  30.64 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  33.86 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  33.86 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  29.96 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  33.86 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  33.86 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  29.46 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  30.29 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  30.42 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  35.57 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  30.89 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  32.8 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  32.8 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  32.8 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  31.91 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  30.38 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  28.22 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  34.92 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  32.8 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  32.8 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  30.36 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  30.21 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  30.96 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  29.55 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  29.88 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  29.66 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  29.46 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  32.8 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  29.74 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  28.69 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  28.69 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  28.69 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  30.08 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  34.18 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  34.55 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  31.75 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1866  ribonuclease PH  32.28 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0439294  normal  0.0144701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  29.63 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3443  ribonuclease PH  36.32 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3507  ribonuclease PH  36.32 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  31.75 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  30.83 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  30.83 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  33.86 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  30.83 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  29.83 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  30.83 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>