More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_38006 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  35.48 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  33.2 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  34.11 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  36.49 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  28.57 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  33.62 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  30.63 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  30.8 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  30.22 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  30.37 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  31.36 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  29.22 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  28.63 
 
 		 501 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  32.71 
 
 		 343 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  32.94 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  28.5 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  30 
 
 		 140 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  26.18 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  25.88 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1541  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.47 
 
 		 717 aa  65.5  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  29.89 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  26.72 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12216  predicted protein  28.05 
 
 		 679 aa  62.4  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.115533  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1444  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.64 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  27.27 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  28.35 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  27.27 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  26.27 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  25.53 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  29.57 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.84 
 
 		 703 aa  60.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.13 
 
 		 701 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  29.57 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  25.86 
 
 		 693 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  29.57 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  29.57 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  29.57 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  29.57 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  29.57 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  30 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  25.95 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  25.43 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.34 
 
 		 703 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  25.54 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0934  3' exoribonuclease  28.07 
 
 		 741 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00161965  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0339  tRNA nucleotidyltransferase  25 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14569  predicted protein  28.65 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0889855 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1106  ribonuclease PH  26.6 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  27.49 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  27.49 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  26.4 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  23.08 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  26.6 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  27.6 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  29.87 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  27.6 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  29.82 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16651  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  25.86 
 
 		 722 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409727  normal  0.910712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.6 
 
 		 699 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  24.19 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  27.65 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1442  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  27.23 
 
 		 735 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0810  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  25.43 
 
 		 722 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  27.65 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0382  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  24.58 
 
 		 714 aa  56.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.320403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1071  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  25.73 
 
 		 718 aa  56.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.679372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  24.46 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  27.65 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  27.65 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  26.47 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1656  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  27 
 
 		 736 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.18 
 
 		 700 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  28.36 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0413  ribonuclease PH  30.65 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.24 
 
 		 747 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000737281  hitchhiker  0.00038852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  26.14 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  25.38 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  25.38 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  25.38 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  25.38 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  25.38 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12322  predicted protein  36.69 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.683046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  25.38 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  25.38 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  25.38 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.82 
 
 		 699 aa  55.1  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12288  putative polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.75 
 
 		 741 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  23.08 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  26.55 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  25.89 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  24.69 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  23.93 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.11 
 
 		 702 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2745  ribonuclease PH  25.85 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32283  Exosome complex exonuclease RRP46 (Ribosomal RNA processing protein 46)  28.29 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0605509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3479  ribonuclease PH  25.28 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>