167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND05300 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  524  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  38.29 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  36.9 
 
 
265 aa  149  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  35.14 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  32.91 
 
 
246 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  31.22 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  34.19 
 
 
501 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  31.44 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  31.91 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  31.51 
 
 
245 aa  115  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  35.05 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  32.91 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  28.76 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  32.05 
 
 
343 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  31.28 
 
 
242 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  28.19 
 
 
245 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  30.38 
 
 
246 aa  99  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  33.8 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  27.39 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  26.89 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  29.03 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57180  exosome exoribonuclease  28.5 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.659196  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  26.01 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  27.03 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32283  Exosome complex exonuclease RRP46 (Ribosomal RNA processing protein 46)  29.57 
 
 
226 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0605509  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2658  ribonuclease PH  30.11 
 
 
237 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.624871  normal  0.811384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  26.74 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  26.74 
 
 
239 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  23.95 
 
 
239 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  26.58 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0010  ribonuclease PH  27.27 
 
 
239 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  26.58 
 
 
237 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  26.24 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  27.42 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1221  ribonuclease PH  28.49 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0468806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  26.6 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  27.42 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  27.62 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  28.88 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2882  ribonuclease PH  28.49 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  29.03 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  26.13 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  26.7 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  27.27 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  29.32 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0182  ribonuclease PH  25.67 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2535  ribonuclease PH  29.51 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  27.96 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0173  ribonuclease PH  26.2 
 
 
238 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2745  ribonuclease PH  30.05 
 
 
239 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0325  ribonuclease PH  26.79 
 
 
239 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  28.5 
 
 
258 aa  52  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  28.96 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0167  ribonuclease PH  26.2 
 
 
238 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  27.9 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  25.56 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  30.69 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  30.69 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92599  predicted protein  25.97 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798783  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  30.69 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  30.69 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  30.69 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  26.07 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  26.13 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  27.59 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  26.13 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  24.66 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  24.77 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  30.16 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  24.44 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  30.69 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  27.87 
 
 
237 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  24.63 
 
 
241 aa  49.3  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  27.87 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  24.15 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0193  ribonuclease PH  27.45 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  26.92 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5092  ribonuclease PH  28.02 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000962489  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  29.02 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  25.81 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  26.23 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  29.02 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  27.62 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  28.21 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  26.21 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  28.21 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  26.83 
 
 
705 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  28.21 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  27.67 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  28.65 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  27.37 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  28.21 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  28.21 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  28.21 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  28.21 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0567  ribonuclease PH  29.41 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  24.88 
 
 
243 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0434  ribonuclease PH  25.81 
 
 
237 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  26.9 
 
 
252 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0469  ribonuclease PH  24.31 
 
 
237 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.221251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>