134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12322 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12322  predicted protein  100 
 
 		 212 aa  433  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.683046  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  33.85 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  33.5 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  30.39 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  32.02 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  33.98 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  33.5 
 
 		 246 aa  92.8  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  34.65 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  31.22 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  28.77 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  32.68 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  31.03 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  32.52 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  36.69 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14569  predicted protein  30.86 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0889855 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  32.86 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  25.38 
 
 		 501 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  25.76 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92599  predicted protein  29.28 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798783  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  29.12 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  28.64 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  31.19 
 
 		 262 aa  52.4  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  29.89 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  29.89 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  29.89 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  29.89 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  28.76 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  29.35 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  29.35 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  27.23 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  29.35 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  29.35 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  29.89 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  29.35 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  31.67 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  25.82 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0370  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0369  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0395  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000781282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0381  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57180  exosome exoribonuclease  20.92 
 
 		 289 aa  48.9  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.659196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  30.49 
 
 		 247 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  25.11 
 
 		 246 aa  48.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  28.42 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  28.18 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  28.8 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  25.12 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  28.18 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  26.36 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  27.81 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3836  ribonuclease PH  27.32 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  26.78 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  24.55 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  27.81 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  24.55 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  25.18 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  27.19 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  25.69 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  26.11 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  26.78 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  28.98 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  30.29 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  26.16 
 
 		 252 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  28.92 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  27.93 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3479  ribonuclease PH  27.91 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  28 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  25.56 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  27.32 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  26.78 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  26.88 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  25.81 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  28.41 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  26.55 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  31.39 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  26.43 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  26.63 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1364  ribonuclease PH  29.23 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>