66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_92599 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_92599  predicted protein  100 
 
 
240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798783  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  31.6 
 
 
245 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  28.63 
 
 
244 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  32.47 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  28.38 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  30.13 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  29.26 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  29.87 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  31.09 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  28.38 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  30.13 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  29.26 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  26.97 
 
 
501 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57180  exosome exoribonuclease  25 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.659196  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  28.45 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  29.64 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12322  predicted protein  30.18 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.683046  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  29.41 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  28.92 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  24.18 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  24.28 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.49 
 
 
690 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.49 
 
 
692 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  31.58 
 
 
242 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02640  conserved hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.52035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  26.61 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  28.51 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  29.14 
 
 
254 aa  45.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  22.13 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  22.13 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  22.13 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  21.4 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  22.13 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  22.13 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  27.38 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  22.13 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  22.13 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  22.13 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  25.2 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  22.13 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  21.4 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  21.05 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14569  predicted protein  27.78 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0889855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0178  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.87 
 
 
712 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  23.36 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  25.69 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  28.97 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  30.82 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  30.77 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  29.86 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.32 
 
 
713 aa  43.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002613  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30 
 
 
711 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.41 
 
 
706 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  29.17 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  29.17 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3342  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.56 
 
 
722 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  24.06 
 
 
257 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  30.07 
 
 
239 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.85 
 
 
703 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.25 
 
 
706 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.61 
 
 
711 aa  42  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0602  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.52 
 
 
718 aa  42  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  30.07 
 
 
239 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  28.19 
 
 
239 aa  41.6  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0589  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.25 
 
 
706 aa  42  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>