20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57180 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57180  exosome exoribonuclease  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.659196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  30.51 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  30.1 
 
 		 245 aa  89.4  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  27.45 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  28.29 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  26.21 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  28.71 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  30.05 
 
 		 501 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  28.7 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  26.54 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  28.25 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  28.57 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  29.65 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02153  3' exoribonuclease family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15980)  25.93 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  26.6 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02640  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.52035  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92599  predicted protein  22.1 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798783  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  25.14 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  22.18 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  22.39 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>