38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02640 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ02640  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.52035  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  31.84 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  31.72 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57180  exosome exoribonuclease  27.03 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.659196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  32.99 
 
 		 245 aa  96.3  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  28.89 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02153  3' exoribonuclease family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15980)  31.51 
 
 		 324 aa  92.4  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  30.36 
 
 		 246 aa  92.4  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  29.91 
 
 		 246 aa  92  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  28.57 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  35.33 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  27.75 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  30.8 
 
 		 246 aa  85.5  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  28.7 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  33.33 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  26.79 
 
 		 343 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  31.9 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92599  predicted protein  23.71 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  26.79 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  32.28 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  27.05 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  29.93 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  28.37 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1701  ribonuclease PH  32.14 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.17915  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  25.1 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  28.77 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  27.91 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  29.14 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  29.41 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  25.84 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  25.36 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3830  ribonuclease PH  30.82 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3918  ribonuclease PH  30.82 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3844  ribonuclease PH  30.82 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  25.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  27.74 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  24.51 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>