14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02153 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02153  3' exoribonuclease family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15980)  100 
 
 
324 aa  658    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57180  exosome exoribonuclease  25.93 
 
 
289 aa  89  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.659196  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02640  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 
268 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.52035  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  25.64 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  27.27 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  28.71 
 
 
242 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  27.78 
 
 
245 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  26.92 
 
 
245 aa  64.3  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  25 
 
 
246 aa  62.8  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  25.53 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  25.21 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  23.78 
 
 
246 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  22.73 
 
 
246 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  25.11 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>