More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2745 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2745  ribonuclease PH  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  56.49 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  55.42 
 
 		 238 aa  254  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  56.25 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  55.65 
 
 		 242 aa  252  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  55.88 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  54.39 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  56.07 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  55.42 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  54.39 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  54.39 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  53.75 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  55.65 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  54.58 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  54.17 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3035  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 242 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  54.81 
 
 		 238 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  55.04 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  52.3 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  53.97 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  52.08 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  53.19 
 
 		 241 aa  238  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 242 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 242 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  52.3 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2671  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 247 aa  238  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0186  ribonuclease PH  51.88 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  51.88 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  52.08 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  53.36 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  51.46 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  52.92 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  51.88 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  52.94 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  53.33 
 
 		 260 aa  234  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  51.68 
 
 		 246 aa  235  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  52.7 
 
 		 258 aa  234  8e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  50.62 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 238 aa  234  9e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  52.1 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  52.1 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  54.13 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  53.56 
 
 		 244 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  52.1 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  51.25 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  52.1 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  53.56 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  54.2 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  52.92 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  50.83 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  52.5 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  52.28 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  53.56 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  51.46 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  52.1 
 
 		 239 aa  231  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  53.75 
 
 		 261 aa  231  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  50.83 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  50.83 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  50.83 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  50.83 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  50.83 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  50.83 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  51.88 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  53.33 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  50.83 
 
 		 243 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  52.92 
 
 		 240 aa  231  8.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  52.7 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  53.14 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  53.91 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  52.3 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0193  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1525  ribonuclease PH  51.69 
 
 		 246 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.037998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  52.7 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  52.7 
 
 		 260 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0325  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  52.08 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  51.26 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  51.26 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  54.17 
 
 		 237 aa  228  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  52.92 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>