More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0906 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.64 
 
 
716 aa  669    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.382985  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4382  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.83 
 
 
712 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0288  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.08 
 
 
730 aa  666    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0388227 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.2 
 
 
690 aa  643    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  100 
 
 
757 aa  1546    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.103984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42780  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.31 
 
 
702 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5457  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.41 
 
 
701 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.95 
 
 
714 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0743  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.22 
 
 
713 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0436  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.04 
 
 
722 aa  658    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0338  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  63.52 
 
 
796 aa  884    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0332916  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.06 
 
 
692 aa  643    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.66 
 
 
718 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  46.98 
 
 
714 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2116  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.2 
 
 
695 aa  656    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.375436  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1112  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 
716 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2075  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.93 
 
 
712 aa  676    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.57561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3604  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.9 
 
 
725 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0558589  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2918  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 
740 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777239  normal  0.227939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4916  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.05 
 
 
725 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1258  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.37 
 
 
733 aa  664    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0939  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.29 
 
 
739 aa  653    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57478  normal  0.652932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3785  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.97 
 
 
708 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.668029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4027  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.57 
 
 
752 aa  650    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.749576  normal  0.189287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0605  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.51 
 
 
718 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  61.8 
 
 
796 aa  885    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.51 
 
 
706 aa  652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.8 
 
 
715 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.102378 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.25 
 
 
712 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0227  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.83 
 
 
722 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133448  normal  0.547858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.88 
 
 
707 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0035  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.49 
 
 
748 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2997  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.31 
 
 
711 aa  685    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3192  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.09 
 
 
715 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.002791  normal  0.0369352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0078  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.3 
 
 
711 aa  663    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901584  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0543  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.51 
 
 
771 aa  635    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.109089  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2081  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.52 
 
 
714 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0369235  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4396  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.57 
 
 
745 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.735081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3935  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.93 
 
 
715 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.57 
 
 
728 aa  641    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0176906  hitchhiker  0.00320297 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2759  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.22 
 
 
736 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00521923  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4507  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.29 
 
 
745 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.398327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.56 
 
 
720 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2897  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.05 
 
 
725 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0175  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.8 
 
 
714 aa  645    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3050  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.1 
 
 
710 aa  656    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.464324  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62710  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.41 
 
 
701 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14789  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2774  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 
716 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0369  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.29 
 
 
717 aa  662    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3446  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.81 
 
 
714 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.16 
 
 
720 aa  663    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733598  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.97 
 
 
696 aa  634  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.97 
 
 
696 aa  634  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1007  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.19 
 
 
693 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0328519  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2482  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.52 
 
 
772 aa  632  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.676792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3810  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.13 
 
 
774 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2816  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.93 
 
 
729 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0783  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.97 
 
 
701 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00491346  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4486  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  47.5 
 
 
701 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4176  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.35 
 
 
701 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310509  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4708  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.81 
 
 
701 aa  618  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0725  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.55 
 
 
701 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.959792  normal  0.0305384 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2685  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.54 
 
 
729 aa  617  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2822  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.24 
 
 
700 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000990055  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4573  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.81 
 
 
701 aa  618  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.348013  normal  0.924419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.52 
 
 
701 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181629  normal  0.111929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0071  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.73 
 
 
714 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000128899  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.03 
 
 
701 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1209  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.86 
 
 
702 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1745  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.74 
 
 
702 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1035  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.72 
 
 
699 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000390234  hitchhiker  0.0000000630128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3556  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.58 
 
 
702 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.13 
 
 
703 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3384  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.24 
 
 
704 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000712799  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.87 
 
 
718 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0982499  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3275  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.13 
 
 
700 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000261182  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1129  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.78 
 
 
694 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.34 
 
 
722 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3218  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.35 
 
 
716 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.634558  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1133  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.13 
 
 
699 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000984141  unclonable  0.0000000000121656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3412  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.13 
 
 
700 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000844924  hitchhiker  0.000972679 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1641  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.05 
 
 
715 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0365038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0966  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.57 
 
 
699 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000874082  normal  0.0188392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.57 
 
 
699 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000012543  hitchhiker  0.000000583672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1096  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.57 
 
 
699 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0013386  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2253  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.05 
 
 
715 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0825  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.34 
 
 
698 aa  605  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0159879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1024  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.62 
 
 
715 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.547998 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2277  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.91 
 
 
715 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000289568  normal  0.091907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5581  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.3 
 
 
715 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298486  normal  0.0925755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2170  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.3 
 
 
714 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402548  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2829  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.79 
 
 
699 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000362505  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2291  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.3 
 
 
714 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0701506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.02 
 
 
696 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1834  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.15 
 
 
713 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0408  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.15 
 
 
713 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.3 
 
 
696 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2811  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.05 
 
 
702 aa  601  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212974  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0178  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.82 
 
 
712 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1125  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.15 
 
 
713 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>