More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0200 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  100 
 
 		 259 aa  517  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  61.33 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  54.3 
 
 		 257 aa  304  8.000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  52.61 
 
 		 270 aa  252  5.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  43.97 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  42.57 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  39.92 
 
 		 275 aa  181  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  38.84 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.31 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  41.42 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  41.3 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  42.67 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  35.71 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  32.05 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  29.22 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  28.69 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  31.86 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  27.36 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  26.72 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  27.46 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  27.44 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  28.84 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  27.98 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  28.84 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  27.91 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1106  ribonuclease PH  29.91 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  28.25 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  27.44 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  28.09 
 
 		 764 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  27.91 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  27.43 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  27.11 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26622  predicted protein  34.11 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.604271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  27.11 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  27.44 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  27.75 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  25.52 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  27.98 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  27.06 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  27.06 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  27.52 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  28.45 
 
 		 238 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  26.61 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  26.98 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  26.98 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  26.98 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  27.98 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  27.52 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  27.98 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  27.98 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  26.98 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  27.98 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  26.98 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  27.52 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  27.52 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  27.23 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  27.52 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  27.52 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  27.57 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1073  ribonuclease PH  27.88 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.213098  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  25 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  27.11 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  27.11 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1177  ribonuclease PH  30.52 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.217753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  26.51 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  27.27 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1635  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.62 
 
 		 732 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000929838  normal  0.469097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  27.44 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  26.05 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  28.05 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  25.46 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  25.76 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  26.75 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  26.75 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  26.75 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  26.75 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  26.75 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  26.75 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  26.75 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  26.67 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  26.75 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  26.46 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  27.44 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  27.23 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  26.02 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  26.75 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0552  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27 
 
 		 732 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  26.67 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  28.44 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  26.54 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0934  3' exoribonuclease  24.42 
 
 		 741 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00161965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  26.54 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  26.51 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  24.88 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  26.54 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>