153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1380 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  100 
 
 		 273 aa  546  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  82.66 
 
 		 276 aa  457  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  85.55 
 
 		 274 aa  454  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  80.81 
 
 		 274 aa  425  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.85 
 
 		 279 aa  235  7e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.69 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  44.69 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  39.11 
 
 		 275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  41.43 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  40.77 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  42.67 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  41.99 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  39.03 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  29.6 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  27.83 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  32.84 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  25.75 
 
 		 307 aa  85.5  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  29.59 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  29.54 
 
 		 764 aa  79  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  27.94 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  27.23 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  25.83 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  27.13 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  26.75 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  28.8 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  26.74 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  28.11 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  30.04 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  28.8 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  28.8 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  26.87 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  27.6 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  27.64 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  27.6 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  28.4 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  27.6 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  26.94 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  24.61 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  28.17 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  26.82 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  24.9 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  27.03 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  23.53 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  27.62 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0325  ribonuclease PH  30 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  25.7 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  28.52 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  25.79 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0413  ribonuclease PH  28.94 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  27.2 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  28.85 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  29.03 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  25.62 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  30.52 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  37.11 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  38.14 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  29.84 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  26.8 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  26.86 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  29.08 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  24.39 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  24.4 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  37.11 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  26.56 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  25.89 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  25.61 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0193  ribonuclease PH  29.44 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  27.72 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  36.26 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  26.97 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  26.97 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1073  ribonuclease PH  25.21 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.213098  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  29.37 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  27.78 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26622  predicted protein  26.02 
 
 		 191 aa  48.9  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.604271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  21.88 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0186  ribonuclease PH  28.23 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  27.6 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  28.4 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  27.2 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  29.19 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  30.77 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  27.87 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  27.92 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1177  ribonuclease PH  30.99 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.217753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  26.19 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>