20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59559 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  33.56 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  36.03 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  27.73 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  24.63 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  30.08 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.6 
 
 		 257 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  28.05 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.55 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.69 
 
 		 259 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  29.38 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.79 
 
 		 276 aa  89.4  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  22.98 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.35 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.56 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  25.75 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.92 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  23.24 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  24.71 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  21.74 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>