More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0237 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0237  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  100 
 
 
711 aa  1451    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.348858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1390  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  67.17 
 
 
719 aa  982    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0953  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  69.84 
 
 
735 aa  1041    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1269  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  67.03 
 
 
719 aa  985    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124632  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0600  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  59.79 
 
 
746 aa  869    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0317346  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0428  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.75 
 
 
721 aa  702    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000339931  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0508  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  65.07 
 
 
702 aa  942    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.412666  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0472  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  67.03 
 
 
718 aa  981    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0212673  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0488  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  69.13 
 
 
732 aa  1031    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1257  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  68.63 
 
 
728 aa  1035    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2116  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.85 
 
 
695 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.375436  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.45 
 
 
696 aa  520  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.45 
 
 
696 aa  520  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0071  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.9 
 
 
714 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000128899  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5581  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.13 
 
 
715 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298486  normal  0.0925755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1420  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.62 
 
 
703 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0845346  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0868  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.55 
 
 
727 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1024  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.08 
 
 
715 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.547998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2816  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.88 
 
 
729 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0693  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 
706 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0464736  normal  0.106902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1430  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.94 
 
 
713 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2170  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.85 
 
 
714 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402548  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1285  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.94 
 
 
713 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.8 
 
 
713 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00845594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1745  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.94 
 
 
702 aa  512  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1294  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.94 
 
 
713 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0739218  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1007  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.26 
 
 
693 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0328519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1259  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.55 
 
 
758 aa  515  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.140666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.83 
 
 
720 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2291  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.85 
 
 
714 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0701506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2277  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.71 
 
 
715 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000289568  normal  0.091907 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0408  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.94 
 
 
713 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1834  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.94 
 
 
713 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0742  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.94 
 
 
713 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0953  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.55 
 
 
727 aa  512  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928829 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1125  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.94 
 
 
713 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1309  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.88 
 
 
691 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2685  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.36 
 
 
729 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1129  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.84 
 
 
694 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3670  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.86 
 
 
723 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3260  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.9 
 
 
707 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0175  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.22 
 
 
714 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1641  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.71 
 
 
715 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0365038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2253  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.71 
 
 
715 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529509  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.2 
 
 
701 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4382  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.11 
 
 
712 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1696  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.15 
 
 
699 aa  504  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00000649299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3192  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.16 
 
 
715 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.002791  normal  0.0369352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.09 
 
 
718 aa  505  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0982499  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.03 
 
 
690 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.26 
 
 
712 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339212  normal  0.44313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1489  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.86 
 
 
706 aa  504  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3218  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.23 
 
 
716 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.634558  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.32 
 
 
815 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3935  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.68 
 
 
715 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138516  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.03 
 
 
692 aa  505  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1979  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.5 
 
 
710 aa  500  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000019638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1360  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.77 
 
 
698 aa  502  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5184  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.9 
 
 
753 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161227  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1334  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.77 
 
 
698 aa  502  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799065  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2067  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.53 
 
 
717 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0957  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.17 
 
 
728 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1258  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.79 
 
 
733 aa  501  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0939  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.16 
 
 
739 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57478  normal  0.652932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0923  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.03 
 
 
725 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3514  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.42 
 
 
772 aa  502  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4507  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.02 
 
 
745 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.398327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1896  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.94 
 
 
724 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336767  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.1 
 
 
699 aa  501  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.4 
 
 
712 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.21 
 
 
697 aa  497  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2897  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.03 
 
 
725 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1399  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.35 
 
 
751 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104449  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.1 
 
 
705 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4027  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.61 
 
 
752 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.749576  normal  0.189287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4396  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.61 
 
 
745 aa  498  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.735081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2553  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.15 
 
 
701 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.587578  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0729  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.99 
 
 
695 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504772  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.76 
 
 
708 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.76 
 
 
708 aa  496  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2219  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.8 
 
 
724 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.656626  normal  0.69654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2017  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.94 
 
 
718 aa  497  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000536157  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.31 
 
 
693 aa  498  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.58 
 
 
714 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3232  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.93 
 
 
761 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.555601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.88 
 
 
716 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.382985  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.5 
 
 
718 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.5 
 
 
706 aa  495  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0227  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.53 
 
 
722 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133448  normal  0.547858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0489  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.62 
 
 
742 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.554464 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0635  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.62 
 
 
716 aa  495  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.64 
 
 
722 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3446  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.48 
 
 
714 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.55 
 
 
696 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0968  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.36 
 
 
706 aa  495  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3342  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.58 
 
 
722 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4916  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.26 
 
 
725 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.22 
 
 
711 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0605  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.32 
 
 
718 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.53 
 
 
722 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>