More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0488 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1390  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  69.57 
 
 
719 aa  999    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0237  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  69.13 
 
 
711 aa  1031    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.348858  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0953  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  91.29 
 
 
735 aa  1374    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0428  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  54.79 
 
 
721 aa  780    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000339931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0600  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  67.51 
 
 
746 aa  992    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0317346  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0472  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  70.07 
 
 
718 aa  1001    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1269  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  69.7 
 
 
719 aa  1003    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124632  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0488  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  100 
 
 
732 aa  1483    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0508  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  66.71 
 
 
702 aa  958    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.412666  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1257  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  79.32 
 
 
728 aa  1172    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.49 
 
 
696 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.49 
 
 
696 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2291  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.01 
 
 
714 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0701506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2170  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.01 
 
 
714 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402548  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2277  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.74 
 
 
715 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000289568  normal  0.091907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5581  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.88 
 
 
715 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298486  normal  0.0925755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.07 
 
 
697 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1024  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.12 
 
 
715 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.547998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.93 
 
 
712 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339212  normal  0.44313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1641  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.74 
 
 
715 aa  515  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0365038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2253  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.74 
 
 
715 aa  515  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1834  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
713 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0408  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
713 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1430  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
713 aa  512  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1285  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
713 aa  512  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0742  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
713 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1294  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
713 aa  512  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0739218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
713 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00845594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3218  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.72 
 
 
716 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.634558  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1125  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
713 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.31 
 
 
718 aa  512  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0982499  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.91 
 
 
696 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.75 
 
 
693 aa  511  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1674  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 
703 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000759629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0968  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.68 
 
 
706 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1309  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.21 
 
 
691 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2116  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.16 
 
 
695 aa  505  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.375436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0071  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.26 
 
 
714 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000128899  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2067  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.02 
 
 
717 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0175  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.92 
 
 
714 aa  502  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4382  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.23 
 
 
712 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3192  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.64 
 
 
715 aa  502  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.002791  normal  0.0369352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.16 
 
 
716 aa  502  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.382985  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4507  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.94 
 
 
745 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.398327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0939  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.4 
 
 
739 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57478  normal  0.652932 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.43 
 
 
705 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1259  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.97 
 
 
758 aa  497  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.140666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.84 
 
 
714 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4027  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.67 
 
 
752 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.749576  normal  0.189287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2816  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.65 
 
 
729 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2685  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.65 
 
 
729 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0369  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.42 
 
 
717 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.63 
 
 
708 aa  498  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1896  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.68 
 
 
724 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336767  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4396  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.67 
 
 
745 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.735081 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2081  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43 
 
 
714 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0369235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1007  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.99 
 
 
693 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0328519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.63 
 
 
708 aa  498  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2897  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.73 
 
 
725 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0953  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.92 
 
 
727 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928829 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.56 
 
 
701 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.86 
 
 
712 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.86 
 
 
714 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0288  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.57 
 
 
730 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0388227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0957  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.8 
 
 
728 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3232  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.85 
 
 
761 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.555601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1745  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.99 
 
 
702 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0552  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.97 
 
 
734 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.368343  normal  0.96834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0868  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.92 
 
 
727 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1979  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.72 
 
 
710 aa  495  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000019638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1696  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.54 
 
 
699 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00000649299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0923  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.08 
 
 
725 aa  495  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.32 
 
 
815 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3935  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.32 
 
 
715 aa  495  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5457  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.93 
 
 
701 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0743  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.54 
 
 
713 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5184  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.53 
 
 
753 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161227  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1334  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.22 
 
 
698 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.89 
 
 
696 aa  492  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.68 
 
 
697 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1258  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 
733 aa  492  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2553  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.1 
 
 
701 aa  492  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.587578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1360  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.22 
 
 
698 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3260  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.17 
 
 
707 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1420  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.06 
 
 
703 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0845346  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4916  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.26 
 
 
725 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62710  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.93 
 
 
701 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14789  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2219  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.39 
 
 
724 aa  492  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.656626  normal  0.69654 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.62 
 
 
699 aa  491  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.14 
 
 
734 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.14 
 
 
711 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.37 
 
 
690 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.3 
 
 
701 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181629  normal  0.111929 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1635  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.82 
 
 
732 aa  486  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000929838  normal  0.469097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1689  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.24 
 
 
728 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  40.14 
 
 
734 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.14 
 
 
711 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.24 
 
 
722 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.37 
 
 
692 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4573  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.3 
 
 
701 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.348013  normal  0.924419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>