More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl270 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl270  RNA polymerase sigma factor  100 
 
 
471 aa  948    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000329288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0503  RNA polymerase sigma factor RpoD  64.96 
 
 
505 aa  647    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103725  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0356  RNA polymerase sigma factor  40.99 
 
 
448 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.429452  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1135  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  51.01 
 
 
602 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00130789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3789  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  49.84 
 
 
584 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3694  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  49.84 
 
 
584 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0805  RpoD family RNA polymerase sigma factor  51.58 
 
 
683 aa  290  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.469743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.51 
 
 
361 aa  289  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  43.24 
 
 
369 aa  289  7e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4047  RpoD family RNA polymerase sigma factor  50 
 
 
586 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000898252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0492  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.27 
 
 
360 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0395  RNA polymerase sigma factor RpoD-like  50.65 
 
 
579 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.309099  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0862  RNA polymerase sigma factor RpoD  40.32 
 
 
638 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0093579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3089  RNA polymerase sigma factor RpoD  50.66 
 
 
577 aa  286  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4216  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.27 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000301264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1113  RNA polymerase sigma factor RpoD  53.44 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000049377  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1241  DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)  57.44 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00483871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2462  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.46 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0127291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0157  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.65 
 
 
375 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3036  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.34 
 
 
650 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672133  normal  0.0730738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2317  RNA polymerase sigma factor RpoD  51.06 
 
 
656 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.1091  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2336  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.99 
 
 
624 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1970  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  48.99 
 
 
631 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.53576  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1223  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  45.12 
 
 
387 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0115586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0658  RpoD family RNA polymerase sigma factor  51.24 
 
 
618 aa  282  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2866  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.81 
 
 
717 aa  282  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1238  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.66 
 
 
666 aa  282  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6775  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.66 
 
 
702 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2414  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
374 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000700134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0895  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.87 
 
 
358 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000160053  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0431  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.11 
 
 
674 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213243  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2440  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
717 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00995293  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  46.57 
 
 
358 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4131  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
714 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138863  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0971  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.66 
 
 
702 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0743249  hitchhiker  0.00275822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2516  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  48.42 
 
 
598 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0713  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  47.02 
 
 
417 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6393  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  51.03 
 
 
697 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7520  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
665 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2235  RNA polymerase sigma factor RpoD  38.84 
 
 
667 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6775  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
666 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183053  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3972  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
711 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379149  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0573  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.2 
 
 
659 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1448  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.69 
 
 
369 aa  280  3e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000454729  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1481  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
698 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3049  RpoD family RNA polymerase sigma factor  51.71 
 
 
582 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000323778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2994  RNA polymerase sigma-70 factor  50.35 
 
 
599 aa  280  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4372  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
375 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000624256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4409  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
375 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000427068  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0621  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
666 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0762  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  48.87 
 
 
819 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.023937  normal  0.967295 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4426  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
375 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2606  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.75 
 
 
855 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10712  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0610  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.29 
 
 
718 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1627  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
683 aa  280  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00680574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4194  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
373 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000145872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4032  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
373 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.92398e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4042  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
373 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000102439  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2310  RNA polymerase sigma factor rpoD (sigma-70)  49.49 
 
 
621 aa  280  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4515  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
373 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000315443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2882  RNA polymerase sigma factor RpoD  50.7 
 
 
696 aa  280  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129916  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0586  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.29 
 
 
667 aa  280  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  0.0214442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0827  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
375 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000804536  decreased coverage  6.75333e-22 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0979  RNA polymerase sigma factor RpoD  50.35 
 
 
669 aa  280  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0235491  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4480  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
805 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4314  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
373 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.2227e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4144  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.24 
 
 
375 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3299  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
685 aa  280  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.269398  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2283  RNA polymerase sigma factor rpoD (sigma-70)  49.49 
 
 
621 aa  280  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2223  RNA polymerase sigma factor RpoD  50 
 
 
684 aa  279  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4265  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
649 aa  280  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.914604  normal  0.695759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2129  RNA polymerase sigma factor RpoD  50 
 
 
710 aa  279  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.22382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4028  RNA polymerase sigma factor RpoD  50.71 
 
 
615 aa  279  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8019  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3783  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
805 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2457  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  51.54 
 
 
588 aa  279  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.36607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3104  RNA polymerase sigma factor RpoD  50 
 
 
681 aa  279  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.218533  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3257  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
805 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0133032  normal  0.0284743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2698  RNA polymerase sigma factor RpoD  50 
 
 
685 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3019  RNA polymerase sigma factor RpoD  54.84 
 
 
373 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000207905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1426  RNA polymerase sigma factor RpoD  55.69 
 
 
369 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0144524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2027  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.75 
 
 
821 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0833  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
800 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2956  RNA polymerase sigma factor RpoD  50 
 
 
685 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661846  normal  0.765968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2678  RNA polymerase, sigma(70) factor  50 
 
 
588 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2204  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
808 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0621  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
800 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0721  sigma 70 (RpoD)  50.68 
 
 
805 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473729  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2525  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
736 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2261  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.97 
 
 
664 aa  279  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.435799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07520  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.48 
 
 
617 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627024  normal  0.302038 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3886  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
805 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673998  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1212  RpoD family RNA polymerase sigma factor  50.83 
 
 
599 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.389301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2420  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.75 
 
 
829 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.814829  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4813  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
804 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0841  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
667 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104141  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3450  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.97 
 
 
668 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472971  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2820  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
680 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1013  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  51.03 
 
 
586 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2049  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.32 
 
 
668 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176039  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6774  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.01 
 
 
681 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.669833  normal  0.0681029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>