267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1687 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1687  putative GAF sensor protein  100 
 
 
306 aa  609  1e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.663879 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2350  putative GAF sensor protein  68.26 
 
 
305 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2566  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.59 
 
 
297 aa  191  9e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
1965 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  36.42 
 
 
417 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
681 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.36 
 
 
740 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.42 
 
 
531 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.76 
 
 
722 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  37.89 
 
 
1428 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.67 
 
 
780 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.07 
 
 
624 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  38.46 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.96 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
680 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35 
 
 
722 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.48 
 
 
727 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.545647  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  37.04 
 
 
595 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2059  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.36 
 
 
718 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0475762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.88 
 
 
1423 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
697 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4396  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  31.55 
 
 
594 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.898588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2169  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.75 
 
 
722 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0648584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  36.91 
 
 
794 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  37.04 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.77 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.6 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  34.19 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.19 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
878 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.29 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  30.41 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0966  diguanylate cyclase  35.37 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.22 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  35.22 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.36 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.36 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.59 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  34.87 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  32.32 
 
 
732 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  34.1 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2664  cyclic diguanylate phosphodiesterase/diguanylate cyclase  34.55 
 
 
600 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  34.36 
 
 
607 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3481  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  32.91 
 
 
592 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.85 
 
 
728 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  28.76 
 
 
801 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
897 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3217  diguanylate cyclase  34.78 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.201545  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1125 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  33.75 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
1550 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 
743 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  33.95 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  33.95 
 
 
743 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10742  predicted protein  34.23 
 
 
153 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  28.33 
 
 
782 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  35.15 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.84 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.53 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.55 
 
 
781 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  36.6 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2011  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.46 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0323841  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  32.68 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2220  diguanylate cyclase  31.1 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3776  hypothetical protein  33.33 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  35.15 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1089  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
409 aa  72.4  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396361  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
438 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  33.12 
 
 
441 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  30.05 
 
 
879 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  33.12 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.33 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  32.91 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1309 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  31.9 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  30.57 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  37.1 
 
 
821 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  31.79 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 
603 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0220  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  35.77 
 
 
598 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3804  EAL domain-containing protein  35.77 
 
 
598 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052374  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.11 
 
 
603 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  33.33 
 
 
1125 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  33.53 
 
 
805 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2505  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  34.16 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.62 
 
 
921 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2863  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
422 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2343  putative GAF sensor protein  32.5 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
819 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000152143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3731  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.37 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  32.24 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03400  two-component sensor molecule, putative  32.92 
 
 
1617 aa  68.9  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.64378  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44514  light histidine kinase  31.41 
 
 
850 aa  69.3  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
1120 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4221  EAL:GAF  31.9 
 
 
607 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>