More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03400 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03400  two-component sensor molecule, putative  100 
 
 
1617 aa  3317    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.64378  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04818  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06140)  29.21 
 
 
1243 aa  254  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.25404  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02581  Histidine kinase G7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ25]  29.63 
 
 
1282 aa  193  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677221 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04113  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 
1205 aa  184  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02363  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01020)  29.54 
 
 
1168 aa  175  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03214  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 
852 aa  172  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal  0.573276 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06820  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00660)  32.42 
 
 
1212 aa  169  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557385 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  36.68 
 
 
694 aa  135  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00160  protein-histidine kinase, putative  24.17 
 
 
1495 aa  135  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 
1965 aa  133  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  40 
 
 
732 aa  128  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.58 
 
 
465 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.75 
 
 
348 aa  127  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.75 
 
 
348 aa  127  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
471 aa  126  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2463  hypothetical protein  44.93 
 
 
341 aa  125  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  40.37 
 
 
327 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  39.66 
 
 
325 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.51 
 
 
323 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
681 aa  124  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.07 
 
 
722 aa  124  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.08 
 
 
326 aa  124  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  36 
 
 
320 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.65 
 
 
321 aa  122  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1255 aa  121  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  37.08 
 
 
401 aa  121  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  36 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  36.49 
 
 
441 aa  119  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  39.47 
 
 
431 aa  120  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  38.29 
 
 
743 aa  120  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.13 
 
 
326 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.92 
 
 
321 aa  119  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.97 
 
 
1917 aa  119  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.29 
 
 
743 aa  118  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
438 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  28.33 
 
 
819 aa  118  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.54 
 
 
442 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.14 
 
 
740 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  43.59 
 
 
344 aa  116  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.93 
 
 
367 aa  116  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2664  cyclic diguanylate phosphodiesterase/diguanylate cyclase  37.89 
 
 
600 aa  115  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  41.79 
 
 
316 aa  115  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  37.34 
 
 
607 aa  115  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2169  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.12 
 
 
722 aa  115  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0648584  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
1363 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  38.17 
 
 
669 aa  115  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
700 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  35.79 
 
 
321 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.58 
 
 
319 aa  113  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  40.24 
 
 
276 aa  113  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.58 
 
 
506 aa  113  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
680 aa  113  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3217  diguanylate cyclase  41.73 
 
 
345 aa  113  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.201545  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.04 
 
 
728 aa  113  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.69 
 
 
722 aa  113  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  38.89 
 
 
398 aa  112  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.62 
 
 
531 aa  112  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.03 
 
 
1114 aa  112  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  28.14 
 
 
2312 aa  112  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  40.91 
 
 
595 aa  112  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2505  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  41.01 
 
 
345 aa  111  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  36.46 
 
 
343 aa  111  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  31.88 
 
 
693 aa  111  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  40.77 
 
 
249 aa  111  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  33.88 
 
 
417 aa  111  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.5 
 
 
327 aa  111  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  31.32 
 
 
1000 aa  110  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
267 aa  110  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
878 aa  110  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  40.77 
 
 
249 aa  110  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  40.52 
 
 
794 aa  110  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  39.39 
 
 
356 aa  110  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4221  EAL:GAF  36.71 
 
 
607 aa  109  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  40.77 
 
 
249 aa  110  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
437 aa  109  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
957 aa  109  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  29.41 
 
 
942 aa  109  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  41.48 
 
 
253 aa  109  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  41.48 
 
 
253 aa  109  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
765 aa  108  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 
713 aa  108  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.3 
 
 
318 aa  108  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.15 
 
 
923 aa  108  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  38.97 
 
 
400 aa  108  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1550 aa  108  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0966  diguanylate cyclase  37.97 
 
 
334 aa  108  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  29.1 
 
 
765 aa  108  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
757 aa  108  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  39.55 
 
 
238 aa  108  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
745 aa  107  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 
1313 aa  107  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  35.93 
 
 
542 aa  107  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  28.57 
 
 
905 aa  107  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
514 aa  107  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3138  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.71 
 
 
345 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 
744 aa  107  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  29.47 
 
 
1407 aa  107  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2059  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.97 
 
 
718 aa  106  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0475762  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0265  histidine kinase  28.15 
 
 
716 aa  106  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.74 
 
 
322 aa  107  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>