More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44514 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44514  light histidine kinase  100 
 
 		 850 aa  1754    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10742  predicted protein  58.17 
 
 		 153 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_52311  diatom response regulator 3  35.67 
 
 		 414 aa  183  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44688  predicted protein  28.34 
 
 		 539 aa  164  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.06 
 
 		 662 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10948  predicted protein  58.77 
 
 		 120 aa  144  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 		 603 aa  140  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  50.99 
 
 		 316 aa  134  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  48 
 
 		 323 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  48 
 
 		 323 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  48 
 
 		 323 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.39 
 
 		 326 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  48 
 
 		 323 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 323 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.74 
 
 		 321 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.02 
 
 		 681 aa  128  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.33 
 
 		 322 aa  128  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.11 
 
 		 323 aa  127  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.67 
 
 		 323 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 		 1965 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.36 
 
 		 319 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45070  predicted protein  33.46 
 
 		 571 aa  121  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  44.67 
 
 		 324 aa  121  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  42.41 
 
 		 251 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 1550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  37.56 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 401 aa  118  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  40.13 
 
 		 471 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.92 
 
 		 318 aa  116  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.94 
 
 		 327 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 399 aa  115  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.23 
 
 		 624 aa  114  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  42.28 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  45.77 
 
 		 327 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  35.24 
 
 		 343 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  43.14 
 
 		 595 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  36.92 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  41.77 
 
 		 607 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.39 
 
 		 722 aa  112  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.91 
 
 		 740 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 897 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  39.67 
 
 		 398 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  41.33 
 
 		 323 aa  111  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.57 
 
 		 728 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.41 
 
 		 579 aa  110  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.5 
 
 		 531 aa  110  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  35.19 
 
 		 694 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 		 878 aa  109  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.93 
 
 		 1114 aa  108  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 514 aa  108  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.64 
 
 		 653 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4221  EAL:GAF  40.51 
 
 		 607 aa  108  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.04 
 
 		 722 aa  108  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.94 
 
 		 465 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  40.27 
 
 		 441 aa  107  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  38.34 
 
 		 267 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  38.34 
 
 		 276 aa  107  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.55 
 
 		 326 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  35.8 
 
 		 226 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 416 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 934 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  41.84 
 
 		 325 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  38.18 
 
 		 732 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  42.21 
 
 		 321 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2169  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.16 
 
 		 722 aa  105  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0648584  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 677 aa  105  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2664  cyclic diguanylate phosphodiesterase/diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 600 aa  105  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 829 aa  104  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2343  putative GAF sensor protein  40 
 
 		 165 aa  104  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  39.24 
 
 		 245 aa  103  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 1001 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 1309 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 389 aa  103  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  39.6 
 
 		 431 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 1002 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  39.56 
 
 		 930 aa  103  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 930 aa  103  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  39.24 
 
 		 500 aa  102  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  37.78 
 
 		 240 aa  102  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  38.97 
 
 		 497 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.84 
 
 		 348 aa  102  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  38.16 
 
 		 336 aa  102  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.16 
 
 		 336 aa  102  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.6 
 
 		 506 aa  102  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.52 
 
 		 743 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 680 aa  102  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.84 
 
 		 348 aa  102  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3481  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  36.88 
 
 		 592 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  36.42 
 
 		 314 aa  101  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  29.08 
 
 		 400 aa  101  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.71 
 
 		 603 aa  101  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13233  predicted protein  46.09 
 
 		 115 aa  101  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  35.71 
 
 		 743 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 		 321 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04157  histidine kinase-response regulator hybrid protein  35.43 
 
 		 306 aa  101  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.851557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.92 
 
 		 1222 aa  100  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3804  EAL domain-containing protein  34.78 
 
 		 598 aa  100  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.66 
 
 		 1000 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  35.95 
 
 		 417 aa  99.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>