154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4348 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 413 aa  768    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  66.58 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  44.28 
 
 		 410 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  40.25 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 		 834 aa  146  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  29.05 
 
 		 1050 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  33.88 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 		 424 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  28.02 
 
 		 918 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04131  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  28.64 
 
 		 698 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966823  normal  0.103258 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  27.25 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.41 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.98 
 
 		 605 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  32.17 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  27.33 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  30.84 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 448 aa  89.7  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  31.64 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  34.97 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  27.44 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  35.88 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  31.5 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  27.77 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.37 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.41 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  32.31 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  26.77 
 
 		 597 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.62 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  27.84 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  25 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  24.62 
 
 		 597 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  34.39 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 622 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  29.03 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 		 610 aa  61.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 		 572 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01920  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  24.02 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.017465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.13 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  25.49 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  33.98 
 
 		 439 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 		 496 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.58 
 
 		 574 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  30.39 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.71 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.39 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 		 608 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  23.87 
 
 		 581 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.77 
 
 		 598 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  24.77 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  27 
 
 		 607 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 573 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  30.77 
 
 		 616 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  26.94 
 
 		 436 aa  50.4  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  25.16 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  25.45 
 
 		 566 aa  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.22 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  26.15 
 
 		 597 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  28.99 
 
 		 542 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  25.38 
 
 		 547 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  22.87 
 
 		 569 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>