116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1073 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  97.34 
 
 		 415 aa  811    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 415 aa  832    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  68.14 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  43.31 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  44.55 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  44.39 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  43.44 
 
 		 424 aa  275  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  40.75 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  38.81 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  39.36 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  40.05 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  44.63 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  42.49 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  35.95 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 420 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  35.61 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  38.8 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  32.48 
 
 		 445 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.82 
 
 		 449 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.88 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 		 413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 		 413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.77 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  29.58 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  30.97 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 		 410 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 		 444 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 440 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 440 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  27.43 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.43 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.43 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  29.54 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  24.16 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  25.27 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.01 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  24.28 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  28.06 
 
 		 834 aa  63.5  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  23.98 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  25.85 
 
 		 918 aa  59.7  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  25.16 
 
 		 598 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  25.96 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  23.45 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  25.28 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  21.92 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2753  Sodium/hydrogen exchanger  23.93 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.36705  normal  0.499741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  23.94 
 
 		 597 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.94 
 
 		 605 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  22.82 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  25.08 
 
 		 597 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  23.4 
 
 		 597 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.78 
 
 		 505 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  31.82 
 
 		 1050 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  22.95 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  22.95 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  22.95 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  22.71 
 
 		 616 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  24.63 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  25.74 
 
 		 626 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  22.19 
 
 		 612 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  24.58 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 		 523 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.52 
 
 		 480 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  28.22 
 
 		 533 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  28.22 
 
 		 533 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  28.63 
 
 		 533 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  24.11 
 
 		 680 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  23.01 
 
 		 498 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>