186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4010 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 423 aa  806    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  54.77 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  57.51 
 
 		 424 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  48.17 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  45.56 
 
 		 424 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  49.75 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  50.37 
 
 		 425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  44.81 
 
 		 437 aa  300  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  42.75 
 
 		 419 aa  299  8e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  46.45 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  41.15 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  40.55 
 
 		 415 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  45.97 
 
 		 421 aa  276  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  48.82 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 		 413 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  39.32 
 
 		 420 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  33.84 
 
 		 432 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  35.14 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  34.71 
 
 		 429 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 		 442 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  34.5 
 
 		 429 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  36.24 
 
 		 445 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.87 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.74 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.57 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.24 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  32.83 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  33.67 
 
 		 454 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.75 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  33.5 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.5 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  34.28 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 		 439 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  28.9 
 
 		 436 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 		 460 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  26.21 
 
 		 834 aa  80.1  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  36.57 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  29.3 
 
 		 918 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  31.15 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  25.48 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  33.23 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  24.19 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  25.34 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  24.38 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  27.71 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  31.36 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  20.29 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  23.34 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  25.88 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.77 
 
 		 1050 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  24.55 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  26.16 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  25.36 
 
 		 596 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.4 
 
 		 596 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.31 
 
 		 596 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.21 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.36 
 
 		 596 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.36 
 
 		 596 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.4 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 572 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  23.61 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  29.23 
 
 		 616 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  28.62 
 
 		 624 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  23.61 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  23.61 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.36 
 
 		 596 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  23.36 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  29.94 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  28.3 
 
 		 624 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  29.94 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  28.12 
 
 		 592 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26 
 
 		 626 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2753  Sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.36705  normal  0.499741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>