218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1580 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 440 aa  846    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  47.95 
 
 		 396 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  51.13 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  41.19 
 
 		 421 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  45.62 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  38.25 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  39.76 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  37 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  38.38 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  39.03 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 		 460 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  35.04 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 408 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  38.46 
 
 		 173 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 429 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  22.47 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  25.49 
 
 		 449 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  29.58 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 		 415 aa  87  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  27.68 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.38 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26.09 
 
 		 626 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  28.8 
 
 		 581 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  37.65 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.61 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  27.98 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.91 
 
 		 597 aa  73.6  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.17 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 		 598 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  27.15 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  24.95 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.68 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.91 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 608 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  26.11 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  26.24 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 		 588 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  20.77 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  24.09 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  24.32 
 
 		 918 aa  60.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  23.19 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  25.56 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  23.64 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.44 
 
 		 598 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  27.31 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  26.16 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  26.44 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  27.23 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.23 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.23 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  25.88 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  27.94 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  29.45 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.54 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  27.25 
 
 		 610 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  22.95 
 
 		 612 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  24.31 
 
 		 610 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>