183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1002 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
408 aa  767    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  66.58 
 
 
413 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  41.19 
 
 
410 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  39.64 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  33.43 
 
 
1050 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  31.61 
 
 
834 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  31.81 
 
 
918 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  28.12 
 
 
605 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  32.59 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  27.16 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 
432 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  27.12 
 
 
415 aa  107  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 
442 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  27.88 
 
 
415 aa  106  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04131  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.13 
 
 
698 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966823  normal  0.103258 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 
424 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 
400 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
419 aa  100  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 
443 aa  96.7  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.93 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  27.97 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 
429 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  34.77 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  34.57 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  35.85 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  38.59 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01920  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  23.66 
 
 
532 aa  73.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.017465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  31.77 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  31.77 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 
448 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  36.48 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 
608 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.44 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  23.39 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  24.93 
 
 
612 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.14 
 
 
464 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  27.69 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.91 
 
 
597 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  28.73 
 
 
572 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  27.93 
 
 
597 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.87 
 
 
448 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  30.12 
 
 
439 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.12 
 
 
439 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 
410 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.88 
 
 
439 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 
423 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
573 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  30.61 
 
 
545 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26 
 
 
596 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  29.5 
 
 
597 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  26.28 
 
 
576 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  36.71 
 
 
439 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 
492 aa  57  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.79 
 
 
449 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 
418 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  24.58 
 
 
420 aa  56.6  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  25.9 
 
 
598 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  25.46 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  27.94 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  25.64 
 
 
546 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  30.54 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 
622 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  27.41 
 
 
454 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  22.29 
 
 
498 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  25.66 
 
 
581 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 
542 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  27.04 
 
 
547 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  26.64 
 
 
454 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 
574 aa  53.1  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  27.69 
 
 
546 aa  53.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  33.12 
 
 
667 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 
741 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
418 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  27.27 
 
 
485 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>