165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2753 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2753  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 442 aa  875    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.36705  normal  0.499741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 		 588 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  30.09 
 
 		 580 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.17 
 
 		 598 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 		 496 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  30.45 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  30.03 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.08 
 
 		 578 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 		 605 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  31.4 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.34 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  31.66 
 
 		 572 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  28.9 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  29.9 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  28.32 
 
 		 576 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  29.28 
 
 		 580 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  26.34 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  29.28 
 
 		 580 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  28.98 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  27.95 
 
 		 538 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  28.98 
 
 		 580 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  28.95 
 
 		 580 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.13 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  27.88 
 
 		 597 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  26.96 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  26.96 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  26.96 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  26.96 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  27.79 
 
 		 580 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  26.96 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0702  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  26.21 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  27.56 
 
 		 597 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  27.2 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  25.94 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  26.73 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  25.99 
 
 		 598 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  26.59 
 
 		 582 aa  67  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.67 
 
 		 597 aa  67  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  28.92 
 
 		 574 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 		 575 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 		 575 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  28.06 
 
 		 573 aa  66.6  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  27.68 
 
 		 610 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  28.45 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  27.49 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3197  potassium/proton antiporter  29.84 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000394197  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.65 
 
 		 596 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  26.67 
 
 		 577 aa  64.3  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  28.06 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  27.15 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.49 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  26.56 
 
 		 498 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  26.93 
 
 		 590 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  28.52 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  27.45 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 		 570 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  28.82 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  27.43 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  27.41 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  27.41 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  27.41 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  25.59 
 
 		 592 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  29.62 
 
 		 598 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  27.41 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  27.49 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  24.02 
 
 		 612 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  27.19 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  27.19 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  28.03 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  26.43 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  26.03 
 
 		 581 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5749  potassium/proton antiporter  28.24 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0152205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  22.5 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  32.74 
 
 		 485 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3583  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  31.97 
 
 		 597 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2947  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 535 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  31.4 
 
 		 575 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.3 
 
 		 483 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  23.84 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  23.68 
 
 		 527 aa  54.3  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  23.93 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2517  potassium/proton antiporter  28.93 
 
 		 590 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  29.17 
 
 		 499 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>