117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1305 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 415 aa  831    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  97.34 
 
 		 415 aa  811    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  66.99 
 
 		 419 aa  565  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  42.55 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  43.3 
 
 		 421 aa  289  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  43.83 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  43.44 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  39.45 
 
 		 437 aa  265  8e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  41.08 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  39.28 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  40.3 
 
 		 423 aa  252  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  45.45 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  41.96 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  36.06 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  34.73 
 
 		 420 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 		 443 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  39.2 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 		 442 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 432 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 		 448 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  32.95 
 
 		 445 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.68 
 
 		 449 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  30.39 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.65 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  30.39 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 		 413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 		 413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.09 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  29.13 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  29.96 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 444 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.65 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  27.65 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.65 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  23.71 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.07 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  25 
 
 		 498 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 		 834 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  25.29 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  23.96 
 
 		 597 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  24.47 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  25.85 
 
 		 918 aa  60.8  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  25.77 
 
 		 597 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  23.78 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  25.39 
 
 		 598 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.82 
 
 		 605 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  24.18 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2753  Sodium/hydrogen exchanger  23.84 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.36705  normal  0.499741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  25.66 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  23.62 
 
 		 597 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  24.53 
 
 		 530 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  24.09 
 
 		 597 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  23.01 
 
 		 597 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.61 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.41 
 
 		 505 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  23.27 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  32.93 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  23.27 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  23.27 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  27.59 
 
 		 1050 aa  50.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 680 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  22.96 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  23.22 
 
 		 612 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  25.81 
 
 		 626 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  24.55 
 
 		 682 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  22.73 
 
 		 481 aa  47  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  26.01 
 
 		 630 aa  46.6  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  28.63 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  29.05 
 
 		 533 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>