More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0393 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  79.7 
 
 		 597 aa  934    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  100 
 
 		 597 aa  1155    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  88.11 
 
 		 597 aa  1038    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  81.61 
 
 		 598 aa  951    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  79.4 
 
 		 597 aa  942    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  87.94 
 
 		 596 aa  1034    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  79.23 
 
 		 597 aa  927    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  51.06 
 
 		 592 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  47.99 
 
 		 574 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  46.89 
 
 		 572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  44.77 
 
 		 575 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  42.83 
 
 		 608 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  44.31 
 
 		 573 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  41.55 
 
 		 597 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  43.15 
 
 		 610 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  42.73 
 
 		 578 aa  385  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  42.15 
 
 		 598 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  39.83 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  40.49 
 
 		 574 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  39.62 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  39.72 
 
 		 576 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  39.79 
 
 		 574 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  38.41 
 
 		 581 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  41.94 
 
 		 624 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  40.49 
 
 		 574 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  40.49 
 
 		 574 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  41.77 
 
 		 624 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.24 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  39.55 
 
 		 576 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  39.55 
 
 		 576 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  39.09 
 
 		 576 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  41.34 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  39.55 
 
 		 576 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  38.9 
 
 		 580 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  37.67 
 
 		 581 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  40.93 
 
 		 570 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  40.42 
 
 		 572 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  41.74 
 
 		 605 aa  364  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  39.17 
 
 		 580 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  39.83 
 
 		 577 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  38.99 
 
 		 580 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  39.17 
 
 		 580 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  38.99 
 
 		 580 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  39.17 
 
 		 575 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  39.17 
 
 		 575 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  38.53 
 
 		 577 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  39.51 
 
 		 580 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  38.35 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  38.35 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  38.35 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  38.35 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  40.75 
 
 		 588 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  38.99 
 
 		 581 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  37.37 
 
 		 573 aa  352  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  40.07 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  40.07 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  39.9 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  40.07 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  39.9 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  39.9 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  40.07 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  39.9 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  40.07 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  39.44 
 
 		 569 aa  345  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  39.18 
 
 		 580 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  38.37 
 
 		 574 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  37.97 
 
 		 582 aa  338  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 		 541 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  37.96 
 
 		 580 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  38.89 
 
 		 538 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  38.53 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  43.62 
 
 		 485 aa  291  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  35.19 
 
 		 596 aa  289  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  38.46 
 
 		 487 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  39.83 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  40.22 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  36.16 
 
 		 590 aa  282  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  39.25 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  37.24 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  37.19 
 
 		 497 aa  266  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  43.04 
 
 		 490 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2517  potassium/proton antiporter  34.92 
 
 		 590 aa  264  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  43.04 
 
 		 490 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  37.45 
 
 		 486 aa  258  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  35.42 
 
 		 481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  42.83 
 
 		 490 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  32.05 
 
 		 498 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  38.69 
 
 		 506 aa  249  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  43.16 
 
 		 414 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  39.65 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  31.43 
 
 		 477 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  47.28 
 
 		 411 aa  247  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  33.83 
 
 		 478 aa  239  8e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  39.13 
 
 		 530 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  39.07 
 
 		 498 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  28.66 
 
 		 527 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3583  sodium/hydrogen exchanger  37.23 
 
 		 402 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  38.09 
 
 		 498 aa  223  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  35.2 
 
 		 498 aa  223  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1109  sodium/hydrogen exchanger  37.26 
 
 		 402 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>