122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5609 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  89.32 
 
 		 440 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 441 aa  856    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  89.32 
 
 		 440 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  89.09 
 
 		 440 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  99.55 
 
 		 441 aa  855    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  83.56 
 
 		 439 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  66.67 
 
 		 441 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  67.05 
 
 		 451 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  69.48 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  69.48 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  69.48 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  62.39 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  53.24 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  52.31 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  51.68 
 
 		 413 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  51.68 
 
 		 413 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  46.3 
 
 		 464 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  43.27 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  45.15 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  44.02 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  45.9 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  38.19 
 
 		 442 aa  262  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  39.31 
 
 		 454 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  37.93 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  36.74 
 
 		 420 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  36.11 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.43 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  32.95 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.58 
 
 		 449 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 		 419 aa  167  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.92 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  29.54 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  31.26 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 		 413 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  30.91 
 
 		 440 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 		 421 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  26.48 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  36.6 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  36.13 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  36.88 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  25.62 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.53 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.89 
 
 		 596 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.01 
 
 		 597 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  27.58 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  25.41 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 		 588 aa  67  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 608 aa  66.6  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  31.29 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 605 aa  63.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 		 573 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  26.49 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  26.49 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  25.99 
 
 		 592 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  22.43 
 
 		 498 aa  57  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  25.85 
 
 		 483 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  25.54 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  25.59 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  36.15 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  24.47 
 
 		 496 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  25.98 
 
 		 485 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  19.69 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  24.82 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 		 572 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3251  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.35 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  27.24 
 
 		 834 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  21.33 
 
 		 481 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  27.21 
 
 		 918 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  29.45 
 
 		 547 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  32.82 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  28.63 
 
 		 500 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  33.74 
 
 		 580 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  27.83 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 617 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  28.48 
 
 		 1050 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  31.17 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>