142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1385 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 419 aa  839    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  68.14 
 
 		 415 aa  589  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  66.99 
 
 		 415 aa  585  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  42.69 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  48.28 
 
 		 421 aa  302  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  48.84 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  45.06 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  43.47 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  45.41 
 
 		 424 aa  288  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  42.57 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  44.92 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  42.27 
 
 		 423 aa  269  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  41.95 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  33.92 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  35.53 
 
 		 420 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  41.16 
 
 		 425 aa  216  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  34.18 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 		 443 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  32.64 
 
 		 442 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  31.41 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 		 445 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 		 429 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 429 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.72 
 
 		 449 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.12 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  30.82 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  29.96 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  31.09 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.68 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  27.59 
 
 		 464 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  30.26 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  25.97 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.9 
 
 		 439 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  28.9 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.9 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 		 460 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  26.47 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.42 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  24.69 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  25.51 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.2 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  24.15 
 
 		 834 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  24.13 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  23.74 
 
 		 918 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  23.89 
 
 		 597 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  26.64 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.16 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.23 
 
 		 1050 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  27.72 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  24.92 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  22.64 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.64 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.19 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.64 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.64 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.8 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.64 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  22.19 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  23.02 
 
 		 478 aa  57  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  24.21 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04131  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  32.06 
 
 		 698 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966823  normal  0.103258 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  30.16 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  21.89 
 
 		 608 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  23.57 
 
 		 596 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  23.2 
 
 		 598 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  21.19 
 
 		 605 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 572 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 		 487 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  23.49 
 
 		 597 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>