234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3971 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 413 aa  830    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  59.7 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  58.73 
 
 		 432 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  36.53 
 
 		 449 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  36.55 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  34.89 
 
 		 442 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  38.82 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  39.95 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  35.91 
 
 		 453 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.47 
 
 		 448 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.33 
 
 		 449 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  35.73 
 
 		 415 aa  216  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  35.84 
 
 		 415 aa  216  5e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  34.95 
 
 		 424 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  32.82 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  32.51 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  35.9 
 
 		 421 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 		 429 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  31.8 
 
 		 454 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  33.02 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  36.71 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  33.09 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  33.09 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  36.03 
 
 		 434 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  32.87 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  34.97 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  35.01 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 440 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 440 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 440 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  27.89 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 		 425 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  31.87 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.87 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.87 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 		 439 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  26.91 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 460 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 		 410 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  24.39 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  26.61 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.03 
 
 		 486 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 		 527 aa  90.9  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  24.23 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  26.97 
 
 		 477 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.8 
 
 		 498 aa  90.1  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  24.27 
 
 		 597 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 		 413 aa  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.54 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.32 
 
 		 496 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.15 
 
 		 483 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  22.63 
 
 		 440 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  23.62 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  22.86 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  26.09 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  24.42 
 
 		 598 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  23.76 
 
 		 918 aa  74.3  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  26.12 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  24.49 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 		 588 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  24.28 
 
 		 597 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  25.2 
 
 		 531 aa  72  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  24.58 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  26.74 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  27.53 
 
 		 580 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 		 637 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  24.88 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  23.22 
 
 		 605 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  24.01 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  23.84 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  24.78 
 
 		 485 aa  66.6  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 		 487 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  27.06 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.52 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  26.81 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  22.33 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  24.28 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  23.2 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  26.81 
 
 		 624 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  20 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  27.55 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  25.37 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  23.95 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>