142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5448 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  89.57 
 
 		 451 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 441 aa  859    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  71.43 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  66.67 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  66.67 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  67.12 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  67.12 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  67.12 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  67.79 
 
 		 439 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.79 
 
 		 439 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.79 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  55.22 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  65.9 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  53.83 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  53.73 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  53.73 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  47.95 
 
 		 449 aa  345  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  45.29 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  44.39 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  44.27 
 
 		 448 aa  302  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  46.48 
 
 		 445 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  39.87 
 
 		 442 aa  266  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.35 
 
 		 448 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.83 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  36.49 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  35.49 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  37.72 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  33.65 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  36.68 
 
 		 454 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  35.03 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.86 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  30.24 
 
 		 419 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  35.15 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 421 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  32.59 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 413 aa  100  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 440 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  27.37 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  34.63 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  37.66 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  32.57 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.6 
 
 		 596 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  26.99 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.91 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  24.21 
 
 		 608 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  22.6 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  25.45 
 
 		 588 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  33.88 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  26.57 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.32 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 		 605 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  24.34 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.39 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 		 573 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  27.56 
 
 		 834 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 		 403 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  28.47 
 
 		 497 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  26.7 
 
 		 486 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  25.51 
 
 		 580 aa  53.9  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  20.88 
 
 		 477 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  32.68 
 
 		 547 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  27.97 
 
 		 918 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2753  Sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.36705  normal  0.499741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  27.71 
 
 		 617 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  26.18 
 
 		 485 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 		 545 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  25.14 
 
 		 592 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  28.31 
 
 		 1050 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  24.47 
 
 		 596 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.47 
 
 		 596 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.47 
 
 		 596 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.47 
 
 		 596 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.47 
 
 		 596 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  33.76 
 
 		 546 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  24.47 
 
 		 596 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  25.19 
 
 		 597 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>