147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3355 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 424 aa  830    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  60.67 
 
 		 421 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  54.9 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  54.27 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  45.41 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  43.44 
 
 		 415 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  43.44 
 
 		 415 aa  307  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  46.34 
 
 		 423 aa  299  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  43.63 
 
 		 410 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  44.89 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  48.77 
 
 		 434 aa  293  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  42.73 
 
 		 437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  47.38 
 
 		 424 aa  272  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  44.71 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  38.32 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  35.05 
 
 		 413 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  32.48 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  33.79 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  36.49 
 
 		 445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.59 
 
 		 448 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.18 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  32.22 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  34.02 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  35.2 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  33.01 
 
 		 454 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 441 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 		 441 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  33.5 
 
 		 454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.9 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  35.01 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.73 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  32.73 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.73 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  29.86 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  30.74 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 460 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  25.65 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 		 608 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.89 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  32.59 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  28.62 
 
 		 572 aa  63.5  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 		 572 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  25.58 
 
 		 610 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.41 
 
 		 626 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.69 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  25.47 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  23.18 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.18 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.18 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  28.52 
 
 		 605 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.18 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.18 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  28.68 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  24.35 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  25.93 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.18 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  25.94 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  26.01 
 
 		 497 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  22.52 
 
 		 596 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  30.35 
 
 		 592 aa  57  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  31.01 
 
 		 918 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  28.06 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  22.68 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  23.95 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  22.19 
 
 		 498 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 		 541 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  23.61 
 
 		 496 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  27.85 
 
 		 597 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  24.21 
 
 		 624 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 834 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  25.31 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>