160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1720 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
423 aa  817    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  46.44 
 
 
437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  45.24 
 
 
424 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  47.99 
 
 
434 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  45.06 
 
 
419 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  41.97 
 
 
410 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  43.2 
 
 
421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  47.57 
 
 
425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  47.19 
 
 
423 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  43.33 
 
 
424 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  40.75 
 
 
415 aa  278  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  41.08 
 
 
415 aa  275  9e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  47.15 
 
 
424 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  44.02 
 
 
425 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  37.29 
 
 
420 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 
413 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  34.02 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 
432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 
429 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 
429 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 
442 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  29.45 
 
 
449 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 
448 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.88 
 
 
448 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 
413 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 
413 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.09 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 
445 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 
441 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.65 
 
 
451 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  31.22 
 
 
454 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  29.49 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 
453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  27.19 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  28.29 
 
 
421 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.39 
 
 
464 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 
413 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 
440 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 
440 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 
440 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 
410 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  29.51 
 
 
439 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.51 
 
 
439 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.27 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
439 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 
588 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  25.36 
 
 
436 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  27.18 
 
 
918 aa  75.1  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  29.39 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  26.01 
 
 
834 aa  74.7  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  29.45 
 
 
572 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  28.85 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 
531 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  23.9 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  31.9 
 
 
580 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  35.9 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  29.28 
 
 
616 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 
605 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  29.31 
 
 
509 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  25.82 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 
574 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 
487 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 
491 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 
414 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  23.51 
 
 
481 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.41 
 
 
486 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.59 
 
 
483 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  27.84 
 
 
499 aa  60.1  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  25.25 
 
 
581 aa  59.7  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  25.72 
 
 
570 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  25.58 
 
 
597 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 
403 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 
393 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 
541 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  28.33 
 
 
1050 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  25.97 
 
 
580 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  23.62 
 
 
445 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 
408 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  26.2 
 
 
486 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  29.78 
 
 
173 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.97 
 
 
598 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  22 
 
 
478 aa  53.9  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 
597 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  23.28 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>