More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1741 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 393 aa  739    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  63.33 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  65.5 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  65.32 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  63.61 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  63.74 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  34.36 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  34.42 
 
 		 421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 		 413 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  31.41 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 		 420 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 574 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  32.38 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  26.17 
 
 		 481 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 608 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 572 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  27.66 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  26.22 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  26.08 
 
 		 498 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 		 449 aa  96.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  29.47 
 
 		 597 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  29.71 
 
 		 498 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.84 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  26.65 
 
 		 581 aa  94.4  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  24.6 
 
 		 531 aa  93.6  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  28.12 
 
 		 498 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.98 
 
 		 415 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 448 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  26.29 
 
 		 497 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  30.09 
 
 		 616 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  30.74 
 
 		 492 aa  90.5  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 		 487 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 		 573 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  29.3 
 
 		 580 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  24.5 
 
 		 477 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  24.86 
 
 		 445 aa  87  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  27.18 
 
 		 573 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3170  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 		 598 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  28.35 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  28.35 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  29.19 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1109  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  28.07 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  29.03 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  25.4 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  27.66 
 
 		 580 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3583  sodium/hydrogen exchanger  24.13 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  28.12 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  31.21 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 575 aa  82.8  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  27.44 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 570 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  34.84 
 
 		 173 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.63 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  25.76 
 
 		 626 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  26.4 
 
 		 576 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  29.15 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  28.86 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  28.09 
 
 		 509 aa  79.7  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 		 605 aa  79.7  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.19 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.33 
 
 		 578 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.5 
 
 		 581 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  24.93 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  24.93 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  25.19 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  24.93 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  24.93 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  26.41 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  26.84 
 
 		 582 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  24.93 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>