140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2328 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  89.73 
 
 		 449 aa  773    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  100 
 
 		 448 aa  887    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  62.67 
 
 		 453 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  51.66 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  52.12 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  40.45 
 
 		 449 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  40.91 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  39.46 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  38.04 
 
 		 442 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  38.86 
 
 		 445 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  36.73 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  36.68 
 
 		 420 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  38.32 
 
 		 451 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  35.68 
 
 		 429 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 		 432 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 		 441 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  36.61 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 		 413 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 		 413 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.2 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  37.98 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.98 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  35.08 
 
 		 440 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  35.08 
 
 		 440 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  34.85 
 
 		 440 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.79 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.47 
 
 		 415 aa  170  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 		 421 aa  163  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  31.29 
 
 		 434 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 		 423 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 		 424 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  31.94 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.29 
 
 		 410 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  31.33 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  33.61 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  27.19 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  25.17 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  21.91 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  26.64 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  36.77 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  36.13 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  22.59 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  23.53 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  25.51 
 
 		 918 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  23 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  24.47 
 
 		 605 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  30.22 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  25.84 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  23.35 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  23.77 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  25.3 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  21.99 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  25.44 
 
 		 597 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  25.13 
 
 		 598 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  27.51 
 
 		 834 aa  57  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  24.73 
 
 		 616 aa  56.6  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  24.93 
 
 		 610 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  25 
 
 		 597 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  25.14 
 
 		 509 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 530 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  29.45 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  30.06 
 
 		 539 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  29.19 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  24 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.29 
 
 		 626 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  23.14 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  29.03 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  28.92 
 
 		 535 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  28.36 
 
 		 505 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  23.94 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  21.76 
 
 		 524 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  23.1 
 
 		 418 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  25.58 
 
 		 492 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  26.49 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  23.4 
 
 		 1050 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.75 
 
 		 605 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  28.83 
 
 		 533 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>