120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3759 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 425 aa  811    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  43.77 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  48.46 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  46.4 
 
 		 434 aa  279  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  44.5 
 
 		 424 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  43.54 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  42.33 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  44.95 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  40.18 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  40.61 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  46.5 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  43.45 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  38.86 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  41.47 
 
 		 410 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  36.5 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  36.96 
 
 		 420 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.41 
 
 		 449 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  35.19 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.21 
 
 		 448 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  31.19 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 		 444 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 441 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  31.82 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.65 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.07 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  31.07 
 
 		 439 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.07 
 
 		 439 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 		 440 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.07 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 413 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  29.54 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  29.35 
 
 		 918 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  26.32 
 
 		 834 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.79 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.11 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  27.55 
 
 		 1050 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  28.52 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  29.55 
 
 		 610 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  35.04 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  30.74 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.84 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  27.09 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  26.87 
 
 		 616 aa  56.6  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  33.91 
 
 		 505 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  26.34 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  32.56 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  26.19 
 
 		 581 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  28 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  25.1 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  27.77 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.24 
 
 		 626 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  24.29 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  29.27 
 
 		 598 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 574 aa  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  26.46 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 		 570 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3170  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  26.67 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  31.35 
 
 		 569 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  26.12 
 
 		 576 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  29.22 
 
 		 597 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04131  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.47 
 
 		 698 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966823  normal  0.103258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  25.93 
 
 		 597 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2753  Sodium/hydrogen exchanger  25.32 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.36705  normal  0.499741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  30.81 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>