70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83480 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 834 aa  1713    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  41.23 
 
 		 1050 aa  623  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  40.46 
 
 		 918 aa  427  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  31.85 
 
 		 605 aa  248  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04131  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  33.88 
 
 		 698 aa  237  8e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966823  normal  0.103258 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  34.34 
 
 		 480 aa  231  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 410 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 		 413 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01920  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  32.63 
 
 		 532 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.017465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  32.4 
 
 		 410 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 		 408 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  25.11 
 
 		 424 aa  72  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  24.15 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  32.1 
 
 		 412 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  23 
 
 		 437 aa  67  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 		 400 aa  67  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  24.88 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.57 
 
 		 415 aa  64.3  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  28.06 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  49.21 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 435 aa  62  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  25.39 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  23.55 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  40.45 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.65 
 
 		 448 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.23 
 
 		 449 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 445 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 		 424 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.21 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 		 429 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  24.38 
 
 		 581 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  23.73 
 
 		 551 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  25.11 
 
 		 654 aa  52  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  32.8 
 
 		 454 aa  52  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 393 aa  51.6  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  25.49 
 
 		 553 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 		 556 aa  49.7  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  23.73 
 
 		 633 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  23.81 
 
 		 420 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  21.74 
 
 		 548 aa  48.9  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 		 429 aa  48.5  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  21.3 
 
 		 548 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  22.51 
 
 		 577 aa  48.5  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  23.18 
 
 		 551 aa  48.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  26.34 
 
 		 597 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.92 
 
 		 464 aa  47.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  29.41 
 
 		 698 aa  47.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  33.56 
 
 		 413 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  24.19 
 
 		 421 aa  47.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  28.11 
 
 		 399 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  23.73 
 
 		 483 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  23.73 
 
 		 555 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  33.56 
 
 		 413 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  34.02 
 
 		 425 aa  47  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  23.73 
 
 		 555 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  27.17 
 
 		 443 aa  45.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  31.94 
 
 		 454 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  23.63 
 
 		 555 aa  45.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.69 
 
 		 598 aa  44.3  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  23.21 
 
 		 555 aa  44.3  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>