128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2986 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  100 
 
 
439 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.77 
 
 
439 aa  853    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  100 
 
 
439 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  68.02 
 
 
441 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  69.34 
 
 
451 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  72.44 
 
 
440 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  72.21 
 
 
440 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  72.21 
 
 
440 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  69.48 
 
 
441 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  69.7 
 
 
441 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  71.89 
 
 
439 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  66.67 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  56.48 
 
 
429 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  55.56 
 
 
429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  54.57 
 
 
413 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  54.57 
 
 
413 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  46.12 
 
 
464 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  46.26 
 
 
449 aa  316  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  44.86 
 
 
443 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  46.85 
 
 
445 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  42.83 
 
 
448 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  36.55 
 
 
442 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  38 
 
 
453 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.05 
 
 
448 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  38.89 
 
 
454 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.95 
 
 
449 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  38.07 
 
 
420 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  38.51 
 
 
454 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 
413 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 
419 aa  159  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.12 
 
 
415 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 
415 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 
425 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  29.32 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 
410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  35.16 
 
 
421 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  35.23 
 
 
424 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 
423 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 
434 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
424 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  27.83 
 
 
436 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 
421 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 
460 aa  96.3  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  30.57 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 
400 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 
413 aa  94  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  26.61 
 
 
410 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.37 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  29.12 
 
 
597 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.94 
 
 
596 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 
608 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  29.37 
 
 
483 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
393 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.91 
 
 
498 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 
605 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 
588 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  25.39 
 
 
598 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  27.56 
 
 
918 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  28.82 
 
 
497 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.68 
 
 
597 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  28.92 
 
 
486 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  27.64 
 
 
580 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  26.65 
 
 
509 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 
430 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2753  Sodium/hydrogen exchanger  24.22 
 
 
442 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.36705  normal  0.499741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.17 
 
 
487 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.59 
 
 
605 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  25.39 
 
 
597 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.71 
 
 
478 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  21.55 
 
 
477 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  32.86 
 
 
545 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 
491 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  24.8 
 
 
417 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  38.75 
 
 
406 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  25.26 
 
 
597 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 
617 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  26.3 
 
 
597 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
420 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  24.08 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  34.18 
 
 
547 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 
490 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  23.02 
 
 
425 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  23.63 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
604 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  23.56 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  30.46 
 
 
1050 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 
490 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.246697 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>