122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3176 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  90.97 
 
 		 454 aa  733    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  100 
 
 		 454 aa  868    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  51.54 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  52.19 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  52.69 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  42.86 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  40.09 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  41 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  39.82 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  41.29 
 
 		 445 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  37.03 
 
 		 429 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 		 429 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  39.61 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  39.61 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  38.78 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  36.78 
 
 		 413 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  36.78 
 
 		 413 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  32.44 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 		 432 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 		 444 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.63 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  34.57 
 
 		 420 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  39.01 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  39.01 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  39.01 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  38 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  37.58 
 
 		 439 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.13 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 424 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  29.58 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  32.1 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  33.01 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  31.3 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 		 425 aa  97.8  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  40.62 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  37.11 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  40.25 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  25.51 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  26.43 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  32.8 
 
 		 834 aa  63.9  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  26.43 
 
 		 918 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  27.5 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  24.44 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  28.9 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  26.55 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04131  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.4 
 
 		 698 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966823  normal  0.103258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  28.9 
 
 		 1050 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 		 393 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  21.74 
 
 		 527 aa  54.7  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 		 408 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  29.63 
 
 		 396 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  30.5 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  24.53 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  20.4 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  27.59 
 
 		 605 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  32.64 
 
 		 1247 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.02 
 
 		 626 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  29.51 
 
 		 566 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.03 
 
 		 596 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  27.03 
 
 		 596 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  37.29 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  28.96 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  23.89 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.03 
 
 		 596 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.03 
 
 		 596 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.03 
 
 		 596 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22353  predicted protein  27.1 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.03 
 
 		 596 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0702  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 		 411 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  30.6 
 
 		 545 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48886  predicted protein  27.51 
 
 		 813 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.515683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 596 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  27.93 
 
 		 506 aa  46.6  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  25.16 
 
 		 588 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  26.39 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  23.23 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  23.44 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  24.15 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 		 531 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>