177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3897 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  89.35 
 
 		 413 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  89.35 
 
 		 413 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  90.91 
 
 		 429 aa  767    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 429 aa  832    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  55.22 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  54.52 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  55.04 
 
 		 444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  52.37 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  52.37 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  53.24 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  52.37 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  53.47 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  56.48 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  56.48 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  56.48 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  53.24 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  46.15 
 
 		 464 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  44.08 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  46.26 
 
 		 445 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  44.52 
 
 		 448 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  44.42 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  39.22 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  37.03 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.35 
 
 		 448 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.28 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 		 453 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  36.36 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  35.92 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 432 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  33.09 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 		 419 aa  163  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.39 
 
 		 415 aa  162  9e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  32.64 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  33.56 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  35.22 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  35.88 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  29.32 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.07 
 
 		 597 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.93 
 
 		 596 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  24.89 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  29.19 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 		 597 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.17 
 
 		 598 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  27 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.16 
 
 		 498 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.39 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  28.5 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  26.83 
 
 		 741 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  24 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  26.23 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  26.06 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  26.42 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 		 608 aa  63.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  25.47 
 
 		 597 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  23.17 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  23.52 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  24.41 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  25.15 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  26.26 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  26.57 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  25.06 
 
 		 580 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.06 
 
 		 598 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  25.63 
 
 		 592 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  22.88 
 
 		 527 aa  55.8  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  26.25 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  26.08 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  23.41 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 414 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 		 574 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>