More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1844 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 460 aa  890    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  93.61 
 
 		 412 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  71.36 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  68.38 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  66.75 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  63.52 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  30.21 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 		 400 aa  152  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  32.46 
 
 		 396 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  31.89 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  31.33 
 
 		 430 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 530 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 429 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  27.69 
 
 		 572 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.21 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  29.74 
 
 		 616 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  24.18 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.47 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 		 573 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 		 608 aa  98.2  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  26.11 
 
 		 481 aa  97.8  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 		 441 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 		 415 aa  96.7  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  28.75 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  28.5 
 
 		 580 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.24 
 
 		 415 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  26.47 
 
 		 487 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  26.4 
 
 		 498 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.5 
 
 		 598 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.35 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  25.96 
 
 		 597 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  27.55 
 
 		 580 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 413 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.13 
 
 		 477 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 413 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 		 588 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  21.75 
 
 		 612 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.95 
 
 		 597 aa  90.1  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 574 aa  89.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  29.16 
 
 		 597 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.49 
 
 		 578 aa  89  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  26.56 
 
 		 498 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  23.82 
 
 		 531 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5749  potassium/proton antiporter  29.41 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0152205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  26.79 
 
 		 573 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  26.1 
 
 		 574 aa  87.4  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 410 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  27.35 
 
 		 500 aa  87  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  29.15 
 
 		 410 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  28.83 
 
 		 580 aa  86.3  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  25.54 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 570 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.42 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.58 
 
 		 581 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 604 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  26.29 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.71 
 
 		 596 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  27.91 
 
 		 597 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  26.29 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  30.62 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  28.16 
 
 		 597 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 593 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  25.53 
 
 		 581 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  26.37 
 
 		 580 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  26.37 
 
 		 580 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.87 
 
 		 626 aa  83.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  26.1 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  28.64 
 
 		 598 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  26.37 
 
 		 580 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  26.4 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  24.82 
 
 		 598 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  25.58 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  29.58 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  25.95 
 
 		 509 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>