More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3028 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 421 aa  815    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  47.09 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  42.64 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  40.83 
 
 		 436 aa  256  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  41.19 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  41.92 
 
 		 430 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  39.01 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  40.51 
 
 		 406 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  39.85 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  41.15 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  35.23 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  36.03 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 		 400 aa  133  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  32.31 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  29.62 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  41.33 
 
 		 173 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  34.42 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  28.29 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  25 
 
 		 481 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 423 aa  99.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 		 408 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  28.85 
 
 		 597 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 410 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  26.33 
 
 		 576 aa  86.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.05 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  26.41 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  29.45 
 
 		 610 aa  84  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 623 aa  83.2  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  27.95 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  27 
 
 		 626 aa  80.1  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  26.39 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  28.26 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  27.51 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.72 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  24.46 
 
 		 597 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  25.97 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.33 
 
 		 598 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  26 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  22.08 
 
 		 612 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.69 
 
 		 581 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.58 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 741 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  25.52 
 
 		 598 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  28.5 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.64 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  23.98 
 
 		 610 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  23.39 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 		 572 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 		 574 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  23.47 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  24.81 
 
 		 597 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  23.85 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  24.21 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  27.49 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  25.49 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.64 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.25 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  22.32 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  23.27 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  24.68 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.02 
 
 		 1050 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 		 652 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  26.43 
 
 		 592 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  25.93 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.93 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 		 652 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>