More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4262 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 741 aa  1467    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  35.41 
 
 		 607 aa  269  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  32.6 
 
 		 569 aa  248  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 		 652 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  35.99 
 
 		 598 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 		 652 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  36.82 
 
 		 611 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.22 
 
 		 669 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 637 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  34.93 
 
 		 629 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  36.62 
 
 		 611 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 		 619 aa  241  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 		 622 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  35.57 
 
 		 637 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 		 625 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 		 670 aa  237  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 		 673 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  36.92 
 
 		 760 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 		 670 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  36.8 
 
 		 640 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  32.93 
 
 		 597 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  33.47 
 
 		 641 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  39.6 
 
 		 601 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  35.23 
 
 		 599 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 628 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  33.89 
 
 		 599 aa  226  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  35.26 
 
 		 602 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  40.16 
 
 		 660 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  36.69 
 
 		 611 aa  224  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.17 
 
 		 666 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  31.64 
 
 		 616 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  36.43 
 
 		 764 aa  221  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  36.43 
 
 		 763 aa  220  6e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  39.6 
 
 		 601 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  31.89 
 
 		 651 aa  220  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  33.47 
 
 		 602 aa  220  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  35.26 
 
 		 643 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  38.61 
 
 		 608 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 		 660 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 		 660 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 		 660 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  39.11 
 
 		 601 aa  218  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 660 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  34.72 
 
 		 617 aa  215  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  34.74 
 
 		 639 aa  213  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  29.09 
 
 		 625 aa  211  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 		 617 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  31.88 
 
 		 719 aa  206  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 852 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  34.44 
 
 		 617 aa  204  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  41.75 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 		 604 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 		 623 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 702 aa  191  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.16 
 
 		 596 aa  188  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  31.24 
 
 		 606 aa  188  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  27.96 
 
 		 596 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  29.02 
 
 		 612 aa  187  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 596 aa  187  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.26 
 
 		 626 aa  187  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.96 
 
 		 596 aa  187  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.96 
 
 		 596 aa  187  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.96 
 
 		 596 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.96 
 
 		 596 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 		 607 aa  181  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  35.1 
 
 		 584 aa  180  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 		 616 aa  178  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  37.33 
 
 		 421 aa  177  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  36.71 
 
 		 620 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  36.34 
 
 		 399 aa  174  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  33.87 
 
 		 630 aa  174  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.49 
 
 		 399 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  29.74 
 
 		 640 aa  169  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  36.61 
 
 		 402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  26.18 
 
 		 595 aa  163  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.65 
 
 		 414 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.65 
 
 		 414 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 401 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 		 628 aa  159  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.33 
 
 		 401 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  36.46 
 
 		 414 aa  154  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 		 407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  37.4 
 
 		 421 aa  136  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  33.74 
 
 		 609 aa  134  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  29.77 
 
 		 596 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  30.87 
 
 		 598 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  29.11 
 
 		 597 aa  108  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.28 
 
 		 597 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  30.73 
 
 		 592 aa  106  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  27.34 
 
 		 626 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 574 aa  99.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  28.09 
 
 		 580 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  30.08 
 
 		 597 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 588 aa  98.6  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 573 aa  97.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.27 
 
 		 597 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  29.06 
 
 		 597 aa  95.1  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  29.72 
 
 		 624 aa  94.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  29.58 
 
 		 597 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>